RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 KRBOX4Q5JUW0 171 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 HBMQ6B0K9 141 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TTLL10Q6ZVT0 673 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 OR56B4Q8NH76 319 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 F5H5P2 479 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 RFXAPO00287 272 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CHST8Q9H2A9 424 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 RNF186Q9NXI6 227 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 B3GNT2Q9NY97 397 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 H7C1C5 153 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CA12O43570 354 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SC5DO75845 299 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 MAKP20794 623 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CXCR1P25024 350 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 LCN6P62502 163 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 IRF5Q13568 498 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 OR2L2Q8NH16 312 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ST8SIA4Q92187 359 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SAMD11Q96NU1 681 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 GABRB1P18505 474 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 IL32P24001 234 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PBX2P40425 430 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 B4GALNT1Q00973 533 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 DSC1Q08554 894 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 MORN1Q5T089 497 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ZNF546Q86UE3 836 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 UBQLN3Q9H347 655 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 HEPACAM2A8MVW5 462 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SCGNO76038 276 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 DRD2P14416 443 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CRYBB2P43320 205 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PAQR8Q8TEZ7 354 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 UPRTQ96BW1 309 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TM4SF18Q96CE8 201 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ATG4BQ9Y4P1 393 aa14.67□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ZNF878C9JN71 531 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 RAF1P04049 648 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ZNF35P13682 527 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 HSD17B2P37059 387 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 FAM111BQ6SJ93 734 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 NEK7Q8TDX7 302 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 OVCA2Q8WZ82 227 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ACTRT3Q9BYD9 372 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 GPR89BP0CG08 455 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SLC6A12P48065 614 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 C1orf61Q13536 156 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 AMZ1Q400G9 498 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 FAM122CQ6P4D5 195 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ULK3Q6PHR2 472 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CD79BP40259 229 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 RFX2P48378 723 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CTXN1P60606 82 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ACTC1P68032 377 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ACTA1P68133 377 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ZNF511Q8NB15 262 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PINK1Q9BXM7 581 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 Q9N2J8 555 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PRSS3P35030 304 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms