RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 POU1F1P28069 291 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 SERPINB10P48595 397 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 GPR143P51810 404 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 FGFBP1Q14512 234 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 DGUOKQ16854 277 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 RHBDD2Q6NTF9 364 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 RTL4Q6ZR62 310 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 P2RY8Q86VZ1 359 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 TMEM151BQ8IW70 566 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 B3GNT7Q8NFL0 401 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 OR14A16Q8NHC5 309 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 TMEM163Q8TC26 289 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 TMEM239Q8WW34 195 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 TP53INP1Q96A56 240 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 PTCHD1Q96NR3 888 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 DEPDC7Q96QD5 511 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF426Q9BUY5 554 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 PLGRKTQ9HBL7 147 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 APMAPQ9HDC9 416 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 PALMDQ9NP74 551 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 SEC14L4Q9UDX3 406 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 ERGIC3Q9Y282 383 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 MED31Q9Y3C7 131 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 A0A1W2PQD3 144 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 PRODHO43272 600 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 INMTO95050 263 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 ATE1O95260 518 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 IL33O95760 270 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 IFNA16P05015 189 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 CT45A8P0DMV1 189 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 CT45A9P0DMV2 189 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 PCSK6P29122 969 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 GRK5P34947 590 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 PEX19P40855 299 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 SLC9A3P48764 834 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 GFERP55789 205 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 SNAPC1Q16533 368 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 MAPK14Q16539 360 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 CTF1Q16619 201 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 DEFB110Q30KQ9 67 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 KLHL26Q53HC5 615 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 CT45A2Q5DJT8 189 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 ARHGAP40Q5TG30 622 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 TTLL10Q6ZVT0 673 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 AHSA2Q719I0 299 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 COMTD1Q86VU5 262 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 OR2T33Q8NG76 320 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 C16orf52Q8NHV5 167 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 LIPHQ8WWY8 451 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 S100ZQ8WXG8 99 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 PIK3R3Q92569 461 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 TTC9Q92623 222 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 LGALS12Q96DT0 336 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 HSPBAP1Q96EW2 488 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 CCDC74BQ96LY2 380 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 PRSS27Q9BQR3 290 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 JAM3Q9BX67 310 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 ANKRA2Q9H9E1 313 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 FGF21Q9NSA1 209 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 TVP23BQ9NYZ1 205 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 SELENONQ9NZV5 590 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 PISDQ9UG56 409 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 KCNE5Q9UJ90 142 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 ICAM5Q9UMF0 924 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 LOXL2Q9Y4K0 774 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 A0A0B4J2E0 115 aa9.81□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 A0A1B0GX12 115 aa9.81□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 FRG2CA6NGY1 282 aa9.81□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 SERINC4A6NH21 518 aa9.81□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 KLK10O43240 276 aa9.81□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 IDH3BO43837 385 aa9.81□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 ENTPD6O75354 484 aa9.81□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 PTP4A3O75365 173 aa9.81□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 LYPD3O95274 346 aa9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms