RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 CD40LGP29965 261 aa16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 B3GLCTQ6Y288 498 aa16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 OR6C4Q8NGE1 309 aa16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 OR13C2Q8NGS9 318 aa16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 OR51Q1Q8NH59 317 aa16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 TMEM203Q969S6 136 aa16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 OTULINQ96BN8 352 aa16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 KCNS3Q9BQ31 491 aa16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 ASPNQ9BXN1 380 aa16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 RERGLQ9H628 205 aa16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 POLE3Q9NRF9 147 aa16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 STUB1Q9UNE7 303 aa16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 TLCD2A6NGC4 264 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 SNTNA6NMZ2 147 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 FMO6PO60774 539 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 TBXA2RP21731 343 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 RPS19P39019 145 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 GPR3P46089 330 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 WNT4P56705 351 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 PRKCDQ05655 676 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 NDUFAF6Q330K2 333 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 SMARCD3Q6STE5 483 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 THSD4Q6ZMP0 1018 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 LHFPL3Q86UP9 236 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 CPOQ8IVL8 374 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 C16orf52Q8NHV5 167 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 RACGAP1Q9H0H5 632 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 MED20Q9H944 212 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 PDE7BQ9NP56 450 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 POLE4Q9NR33 117 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 SEC14L4Q9UDX3 406 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 CBLCQ9ULV8 474 aa16.71■□□□□ 0.27
USP18-201ENST00000215794 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 CLDN4O14493 209 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 GDF9O60383 454 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 PPP5CP53041 499 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 SKP1P63208 163 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 CLDN22Q8N7P3 220 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 ZFP41Q8N8Y5 198 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 BPIFA2Q96DR5 249 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 HS6ST2Q96MM7 605 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 CD180Q99467 661 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 DUSP23Q9BVJ7 150 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 BARHL1Q9BZE3 327 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 CFL2Q9Y281 166 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 A3GALT2U3KPV4 340 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 CFAP54Q96N23 3096 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 TRAV27A0A087WT01 109 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 A0A0B4J2E0 115 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 A0A1B0GWA3 101 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 A0A1B0GX12 115 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 DLL1O00548 723 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 IFNA16P05015 189 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 NGFRP08138 427 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 CT45A8P0DMV1 189 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 CT45A9P0DMV2 189 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 GLB1P16278 677 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 CPEP16870 476 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 CD1CP29017 333 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 TGM4P49221 684 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 SEPHS1P49903 392 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 CFHR1Q03591 330 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 OXA1LQ15070 435 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 TRIM16LQ309B1 348 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 CT45A2Q5DJT8 189 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 SNAP47Q5SQN1 464 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 ZNF559Q9BR84 538 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 EDEM2Q9BV94 578 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 TEX12Q9BXU0 123 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 MROQ9BYG7 248 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 TMEM27Q9HBJ8 222 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 NCDNQ9UBB6 729 aa16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 TMEM129A0AVI4 362 aa16.69■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 BHLHE40O14503 412 aa16.69■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 PLD2O14939 933 aa16.69■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 PRAMEF2O60811 474 aa16.69■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 ZNF806P0C7X5 589 aa16.69■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 SAGP10523 405 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 RPS25P62851 125 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP16.69■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 DNASE1L3Q13609 305 aa16.69■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.69■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 FCRLBQ6BAA4 426 aa16.69■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 NIPAL1Q6NVV3 410 aa16.69■□□□□ 0.26
USP18-201ENST00000215794 PLBD1Q6P4A8 553 aa16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms