RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029446.12

Csde1-201, Transcript of Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Csde1, Length 4,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1-201ENSMUST00000029446 Olfr671A0A1B0GSN5 317 aa6.59□□□□□ -1.35
Csde1-201ENSMUST00000029446 Kdf1A2A9F4 397 aa6.59□□□□□ -1.35
Csde1-201ENSMUST00000029446 Esp22A8R0V4 111 aa6.59□□□□□ -1.35
Csde1-201ENSMUST00000029446 Gm1110F6Y113 635 aa6.59□□□□□ -1.35
Csde1-201ENSMUST00000029446 Gm8229K7N749 213 aa6.59□□□□□ -1.35
Csde1-201ENSMUST00000029446 Olfr1360K9J6X0 313 aa6.59□□□□□ -1.35
Csde1-201ENSMUST00000029446 Olfr738L7N1X7 311 aa6.59□□□□□ -1.35
Csde1-201ENSMUST00000029446 Prl4a1O35256 227 aa6.59□□□□□ -1.35
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Csde1-201ENSMUST00000029446 Zfp534A2A7A1 661 aa6.59□□□□□ -1.35
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Csde1-201ENSMUST00000029446 Hist1h2aiC0HKE6 130 aa6.59□□□□□ -1.35
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Csde1-201ENSMUST00000029446 Mrpl37Q921S7 423 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Csde1-201ENSMUST00000029446 Mcoln1Q99J21 580 aa6.59□□□□□ -1.35
Csde1-201ENSMUST00000029446 Klhl22Q99JN2 634 aa6.59□□□□□ -1.35
Csde1-201ENSMUST00000029446 Gabra4Q9D6F4 552 aa6.59□□□□□ -1.35
Csde1-201ENSMUST00000029446 Lrrc69Q9D9Q0 347 aa6.59□□□□□ -1.35
Csde1-201ENSMUST00000029446 Ramp2Q9WUP0 189 aa6.59□□□□□ -1.35
Csde1-201ENSMUST00000029446 D17h6s53eQ9Z1R4 293 aa6.59□□□□□ -1.35
Csde1-201ENSMUST00000029446 Olfr675A0A1B0GSE1 317 aa6.59□□□□□ -1.36
Csde1-201ENSMUST00000029446 Gm42372A0A1B0GT27 204 aa6.59□□□□□ -1.36
Csde1-201ENSMUST00000029446 Mllt6B1AR10 1109 aa6.59□□□□□ -1.36
Csde1-201ENSMUST00000029446 Xkr6E9Q6C8 638 aa6.59□□□□□ -1.36
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