RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM64Q6YI46 380 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 STX12Q86Y82 276 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 LAS2Q8IYD9 372 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 MAS1P04201 325 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 RAB3AP20336 220 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 MZT1Q08AG7 82 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 RSU1Q15404 277 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 AWAT2Q6E213 333 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 FRMPD2BQ6IN97 320 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 RETREG3Q86VR2 466 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 GGHQ92820 318 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 EGLN2Q96KS0 407 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 OR5B2Q96R09 309 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 RAB9BQ9NP90 201 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 MMP17Q9ULZ9 603 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF264O43296 627 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 ADAM23O75077 832 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 IL1AP01583 271 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 BCL6P41182 706 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 GPLD1P80108 840 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 GPR18Q14330 331 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 NTRK2Q16620 822 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 CDNFQ49AH0 187 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 SAXO2Q658L1 398 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 RFLNAQ6ZTI6 216 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 DOK4Q8TEW6 326 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 FN3KQ9H479 309 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 CIB4A0PJX0 185 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 SMIM30A4D0T7 59 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 CDHR4A6H8M9 788 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 DIRAS3O95661 229 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 GPX2P18283 190 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 CTHP32929 405 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 PYCR3Q53H96 274 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 SSX6Q7RTT6 188 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 RNF175Q8N4F7 328 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 COQ8AQ8NI60 647 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 ZFP57Q9NU63 452 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 GGT3PA6NGU5 568 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 PRAF2O60831 178 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 GABBR2O75899 941 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 POU2F2P09086 479 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 MAGEA2P43356 314 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 STT3AP46977 705 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 DAPP51397 102 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 PCBD1P61457 104 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 DCDP81605 110 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 ILKQ13418 452 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 OR7A5Q15622 319 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 KCTD9Q7L273 389 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 PXKQ7Z7A4 578 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 TDHQ8IZJ6 230 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 COL4A1P02462 1669 aa6.04□□□□□ -1.44
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