RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 MFSD6LQ8IWD5 586 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 RAB7BQ96AH8 199 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ALG8Q9BVK2 526 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 KLF15Q9UIH9 416 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf226A1L170 272 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 GLOD5A6NK44 160 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CXCL9Q07325 125 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 STEAP3Q658P3 488 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 AGTRAPQ6RW13 159 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 MYADMQ96S97 322 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 FBRSQ9HAH7 460 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 C4orf47A7E2U8 309 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ELK1P19419 428 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TAP2Q03519 686 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 HNF4GQ14541 408 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 MANEALQ5VSG8 457 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TPGS2Q68CL5 300 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OR8D2Q9GZM6 311 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 NIPAL2Q9H841 368 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 RNF19AQ9NV58 838 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 RAB40BQ12829 278 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PMEPA1Q969W9 287 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OR2M5A3KFT3 312 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 GPR25O00155 361 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CD1DP15813 335 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CLDN8P56748 225 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 APOFQ13790 326 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SLC51BQ86UW2 128 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PRRC1Q96M27 445 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 RHCGQ9UBD6 479 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ITGB4P16144 1822 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0U1RQK1 487 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 B4DXG7 233 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 EMC8O43402 210 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OR12D1P0DN82 309 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 EFNA3P52797 238 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 BPIFB3P59826 476 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 LCN6P62502 163 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CHRNEQ04844 493 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF91Q05481 1191 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 LAPTM4AQ15012 233 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TIGITQ495A1 244 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 FAM124AQ86V42 546 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OR4N4Q8N0Y3 316 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PGBD5Q8N414 524 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 FOCADQ5VW36 1801 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 K7EPK0 472 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 YY2O15391 372 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 MT-ND4LP03901 98 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OSMP13725 252 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 GRB7Q14451 532 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CDH26Q8IXH8 852 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SIAH2O43255 324 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SYT7O43581 403 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 G0S2P27469 103 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ACVR1BP36896 505 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CSKP41240 450 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TCTAP57738 103 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 BTN1A1Q13410 526 aa6.6□□□□□ -1.35
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