RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, human

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGEF1-209	ENST00000607882	TNFRSF17	Q02223	184 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	KCNC4	Q03721	635 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRR7	Q8TB68	274 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	GRHL3	Q8TE85	626 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	HMG20A	Q9NP66	347 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	EHD3	Q9NZN3	535 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882		M0R3G1	203 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR10H2	O60403	315 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	UGDH	O60701	494 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	GABARAP	O95166	117 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	IL3	P08700	152 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	CT62	P0C5K7	136 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	RYK	P34925	604 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	GZMM	P51124	257 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	BLVRA	P53004	296 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	VBP1	P61758	197 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	MFAP5	Q13361	173 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF846	Q147U1	533 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF124	Q15973	351 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	RFX4	Q33E94	735 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	PPT2	Q9UMR5	302 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882		A0A096LPI6	279 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	KRT6A	P02538	564 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	KRT6B	P04259	564 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	NAGA	P17050	411 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	CTRB1	P17538	263 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	PSMB9	P28065	219 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	EPHA2	P29317	976 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	KRT6C	P48668	564 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	TNFSF10	P50591	281 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	RUNX1T1	Q06455	604 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	NPTX1	Q15818	432 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	DESI1	Q6ICB0	168 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRR22	Q8IZ63	422 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	RFXANK	O14593	260 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	ITGA10	O75578	1167 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	HSD3B2	P26439	372 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	PTPN6	P29350	595 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	OXA1L	Q15070	435 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR1C1	Q15619	314 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882		Q6ZS92	163 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	ELP5	Q8TE02	316 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	DGAT2	Q96PD7	388 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	ASIC5	Q9NY37	505 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	SPACA6	W5XKT8	324 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	PCDH7	O60245	1069 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	DDAH2	O95865	285 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	SDC1	P18827	310 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	NT5E	P21589	574 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RABGEF1-209	ENST00000607882	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56

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