RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 FN3KQ9H479 309 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 POT1Q9NUX5 634 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 ZNF226Q9NYT6 803 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 BAIAP2Q9UQB8 552 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 CACNA1CQ13936 2221 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 SLC35F4A4IF30 521 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 SAP18O00422 153 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 HAT1O14929 419 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ERI3O43414 337 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 B3GALT2O43825 422 aa7.46□□□□□ -1.22
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GGA3-218ENST00000584243 COQ9O75208 318 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 B3GALT4O96024 378 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 GASTP01350 101 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 OPN1SWP03999 348 aa7.46□□□□□ -1.22
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GGA3-218ENST00000584243 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ACP2P11117 423 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ACP5P13686 325 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 F3P13726 295 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 IDUAP35475 653 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 MAP2K4P45985 399 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 OR1E2P47887 323 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TAS2R41P59536 307 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TAS2R43P59537 309 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 MC1RQ01726 317 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TNFRSF17Q02223 184 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ACSM1Q08AH1 577 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 SLAMF1Q13291 335 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 NFATC4Q14934 902 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 MED22Q15528 200 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 DUSP7Q16829 419 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 MINDY4Q4G0A6 757 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 CDC73Q6P1J9 531 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 HSDL2Q6YN16 418 aa7.46□□□□□ -1.22
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GGA3-218ENST00000584243 ASPGQ86U10 573 aa7.46□□□□□ -1.22
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GGA3-218ENST00000584243 PSD4Q8NDX1 1056 aa7.46□□□□□ -1.22
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GGA3-218ENST00000584243 OR52E1Q8NGJ3 308 aa7.46□□□□□ -1.22
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GGA3-218ENST00000584243 NDNFQ8TB73 568 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ADAMTS15Q8TE58 950 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 GANCQ8TET4 914 aa7.46□□□□□ -1.22
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GGA3-218ENST00000584243 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
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GGA3-218ENST00000584243 WDR92Q96MX6 357 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ARHGDIGQ99819 225 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 C17orf62Q9BQA9 187 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 SLC30A2Q9BRI3 323 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 APOOQ9BUR5 198 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ACAT2Q9BWD1 397 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TWSG1Q9GZX9 223 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 OR51I1Q9H343 314 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 GLIPR2Q9H4G4 154 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 DUSP22Q9NRW4 184 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 RHBDL2Q9NX52 303 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 GPR83Q9NYM4 423 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 POLHQ9Y253 713 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ASB4Q9Y574 426 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 RNF215Q9Y6U7 377 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa7.45□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 A0A0G2JNG1 304 aa7.45□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 PRSS38A1L453 326 aa7.45□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 KIR2DS3K7RE56 304 aa7.45□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 PCDH17O14917 1159 aa7.45□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 GPR37O15354 613 aa7.45□□□□□ -1.22
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