RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576952.1

POLR2A-208, Transcript of RNA polymerase II subunit A, human

TSL 2

Gene POLR2A, Length 532 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR2A-208	ENST00000576952	CRAT	P43155	626 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	ATP4B	P51164	291 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	CCR4	P51679	360 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	HPCA	P84074	193 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	GUCY1A3	Q02108	690 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21	2e-6	■□□□□ 9.1
POLR2A-208	ENST00000576952	FOXF1	Q12946	379 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	FOXF2	Q12947	444 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	SKP2	Q13309	424 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	FGFBP1	Q14512	234 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	GGN	Q86UU5	652 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	GPR119	Q8TDV5	335 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	STON2	Q8WXE9	905 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	WNT2B	Q93097	391 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	PINK1	Q9BXM7	581 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	LIPT1	Q9Y234	373 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952		A0A096LPI6	279 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	C7orf72	A4D263	438 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	CLDN24	A6NM45	220 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	DVL2	O14641	736 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	EFNA2	O43921	213 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	RCBTB2	O95199	551 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	NR2F1	P10589	423 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	CTSS	P25774	331 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	MAPK11	Q15759	364 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	ACBD4	Q8NC06	268 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	OR5W2	Q8NH69	310 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	FBXO27	Q8NI29	283 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	FIG4	Q92562	907 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	TM9SF2	Q99805	663 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	LAT2	Q9GZY6	243 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	MED4	Q9NPJ6	270 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	SLC22A20	A6NK97	555 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	CLIC1	O00299	241 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	PRKCA	P17252	672 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	IGFBP2	P18065	325 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	SHC1	P29353	583 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	PGM1	P36871	562 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	DSTN	P60981	165 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	RAC1	P63000	192 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	PLAUR	Q03405	335 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	CBFB	Q13951	182 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	QPRT	Q15274	297 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	CGB2	Q6NT52	195 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952		A0A0J9YW62	118 aa		13.74	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	BCHE	P06276	602 aa		13.74	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	NUDT7	P0C024	238 aa		13.74	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	SFTPD	P35247	375 aa		13.74	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	DLX5	P56178	289 aa		13.74	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	KCNJ10	P78508	379 aa		13.74	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	PON3	Q15166	354 aa		13.74	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	RGN	Q15493	299 aa		13.74	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	SGCB	Q16585	318 aa		13.74	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
POLR2A-208	ENST00000576952	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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