RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569745.5

CCNDBP1-215, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,356 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-215ENST00000569745 UBL4AP11441 157 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 KHKP50053 298 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 FOXF1Q12946 379 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 FGFBP1Q14512 234 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 TTMPQ5BVD1 217 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 VWA1Q6PCB0 445 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 OLIG3Q7RTU3 272 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 HDXQ7Z353 690 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 OR2V1Q8NHB1 315 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 FBXO27Q8NI29 283 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 OSTF1Q92882 214 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 ROPN1LQ96C74 230 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 ARSGQ96EG1 525 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 C7orf26Q96N11 449 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 OR52B2Q96RD2 323 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 INPP5KQ9BT40 448 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 LAT2Q9GZY6 243 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 RASSF1Q9NS23 344 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 WDR45Q9Y484 360 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 ABCA12Q86UK0 2595 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-215ENST00000569745 A0A0J9YW62 118 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 A6NNC1 897 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 TNFSF11O14788 317 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 EFNA2O43921 213 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 CXCL13O43927 109 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 DIAPH2O60879 1101 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 SYNGR4O95473 234 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 CSTAP01040 98 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 GSNP06396 782 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 PRKCAP17252 672 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 IL11P20809 199 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 ELK4P28324 431 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 CDKN2CP42773 168 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 SIRPAP78324 504 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 CBFBQ13951 182 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 HBMQ6B0K9 141 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 EPGNQ6UW88 154 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 CDH24Q86UP0 819 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 RNF130Q86XS8 419 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 LRRC8CQ8TDW0 803 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 MARK4Q96L34 752 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 MRGPRX4Q96LA9 322 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 KLHL15Q96M94 604 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 TMEM185BQ9H7F4 350 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 GJE1A6NN92 205 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 HMGN4O00479 90 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 RFXANKO14593 260 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 KIAA0513O60268 411 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 CYP7B1O75881 506 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 TGDSO95455 350 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 CGAP01215 116 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 C1QCP02747 245 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 CD8BP10966 210 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 SLC6A8P48029 635 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 PCYT1AP49585 367 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 CARD18P57730 90 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 QPRTQ15274 297 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 MAPK14Q16539 360 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 GPAT3Q53EU6 434 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 DACH2Q96NX9 599 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 TIGARQ9NQ88 270 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 GLRX2Q9NS18 164 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 LIPT1Q9Y234 373 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 PKDREJQ9NTG1 2253 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 CSMD1Q96PZ7 3565 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 LRBAP50851 2863 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms