RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 OR9I1Q8NGQ6 314 aa27.65■■■□□ 2.02
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CMTM4-204ENST00000563952 ZNF175Q9Y473 711 aa27.65■■■□□ 2.02
CMTM4-204ENST00000563952 HMGN4O00479 90 aa27.64■■■□□ 2.02
CMTM4-204ENST00000563952 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
CMTM4-204ENST00000563952 UGT2B17O75795 530 aa27.64■■■□□ 2.02
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CMTM4-204ENST00000563952 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
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CMTM4-204ENST00000563952 POLE3Q9NRF9 147 aa27.63■■■□□ 2.01
CMTM4-204ENST00000563952 CRIM1Q9NZV1 1036 aa27.63■■■□□ 2.01
CMTM4-204ENST00000563952 PACSIN3Q9UKS6 424 aa27.63■■■□□ 2.01
CMTM4-204ENST00000563952 TNFSF11O14788 317 aa27.62■■■□□ 2.01
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CMTM4-204ENST00000563952 VPS33AQ96AX1 596 aa27.62■■■□□ 2.01
CMTM4-204ENST00000563952 PRRG4Q9BZD6 226 aa27.62■■■□□ 2.01
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CMTM4-204ENST00000563952 SLC6A13Q9NSD5 602 aa27.62■■■□□ 2.01
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CMTM4-204ENST00000563952 KRT75O95678 551 aa27.6■■■□□ 2.01
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CMTM4-204ENST00000563952 QPRTQ15274 297 aa27.6■■■□□ 2.01
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CMTM4-204ENST00000563952 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
CMTM4-204ENST00000563952 SAP130Q9H0E3 1048 aa27.6■■■□□ 2.01
CMTM4-204ENST00000563952 GALNT8Q9NY28 637 aa27.6■■■□□ 2.01
CMTM4-204ENST00000563952 ADAMDEC1O15204 470 aa27.59■■■□□ 2.01
CMTM4-204ENST00000563952 SYNGR4O95473 234 aa27.59■■■□□ 2.01
CMTM4-204ENST00000563952 ADH6P28332 368 aa27.59■■■□□ 2.01
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