RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563333.1

SNAP23-205, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 2

Gene SNAP23, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-205ENST00000563333 UBQLNLQ8IYU4 475 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ZNF683Q8IZ20 524 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 RHOXF1Q8NHV9 184 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 TGM7Q96PF1 710 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 OR5B2Q96R09 309 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 SPATA16Q9BXB7 569 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CHIAQ9BZP6 476 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 RHBGQ9H310 441 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 SMOXQ9NWM0 555 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 GALPQ9UBC7 116 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 SPRR3Q9UBC9 169 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 PCSK1NQ9UHG2 260 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 MAB21L2Q9Y586 359 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 FRMPD4Q14CM0 1322 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 PTCH1Q13635 1447 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 MSH4O15457 936 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 PGK1P00558 417 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CCDC166P0CW27 439 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 RNF224P0DH78 156 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 RPS8P62241 208 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 TNFRSF17Q02223 184 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 RAB40BQ12829 278 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ASAH1Q13510 395 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 NDUFA9Q16795 377 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CEP55Q53EZ4 464 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 TPGS2Q68CL5 300 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 SEL1L3Q68CR1 1132 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ZNF774Q6NX45 483 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CXCL17Q6UXB2 119 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 OR2L13Q8N349 312 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 OR4D9Q8NGE8 314 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 OR5D13Q8NGL4 314 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 MS4A14Q96JA4 679 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 OMDQ99983 421 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 SLC30A2Q9BRI3 323 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 FEM1AQ9BSK4 669 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 RNF126Q9BV68 326 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ELOVL4Q9GZR5 314 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 GLT8D2Q9H1C3 349 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 WDR45Q9Y484 360 aa3.37□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 POGZQ7Z3K3 1410 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 TRIM64CA6NLI5 447 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 K7ENP7 123 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 GPAA1O43292 621 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 LRATO95237 230 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 OPN1MWP04001 364 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ZNF853P0CG23 659 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 OPN1MW2P0DN77 364 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 OPN1MW3P0DN78 364 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CYP2B6P20813 491 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 VDAC1P21796 283 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 NF2P35240 595 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 LEPP41159 167 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 VGLL4Q14135 290 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 Q1RN00 199 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 SBK1Q52WX2 424 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CCDC80Q76M96 950 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 SERINC5Q86VE9 423 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CLDN19Q8N6F1 224 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 HAVCR1Q96D42 359 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 MTMR9Q96QG7 549 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CAPS2Q9BXY5 557 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 UBXN6Q9BZV1 441 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 VCPKMTQ9H867 229 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 POLD4Q9HCU8 107 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 APMAPQ9HDC9 416 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 POLE4Q9NR33 117 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ONECUT1Q9UBC0 465 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ABCD2Q9UBJ2 740 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa3.36□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 BTBD17A6NE02 478 aa3.35□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 PP2D1A8MPX8 630 aa3.35□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 FAM220BPB1ANY3 271 aa3.35□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 RBMY1CP0DJD4 496 aa3.35□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ADORA2BP29275 332 aa3.35□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 GRIA1P42261 906 aa3.35□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 OR3A4PP47883 348 aa3.35□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 SLC25A1P53007 311 aa3.35□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 RIPK1Q13546 671 aa3.35□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.35□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 GPRC6AQ5T6X5 926 aa3.35□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 RNLSQ5VYX0 342 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms