RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 ZDHHC22Q8N966 263 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 ZNF540Q8NDQ6 660 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 NUP43Q8NFH3 380 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 OR4F6Q8NGB9 312 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 ZFP90Q8TF47 636 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 MRGPRX4Q96LA9 322 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 CPNE1Q99829 537 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 ELOVL6Q9H5J4 265 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 FKRPQ9H9S5 495 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 LPAR2Q9HBW0 351 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 KLHL9Q9P2J3 617 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 A0A087WV62 115 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 SYCE1LA8MT33 242 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 MYO1GB0I1T2 1018 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 CYTIPO60759 359 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 DAOP14920 347 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 TSPAN8P19075 237 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 EPHA1P21709 976 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 C9orf135Q5VTT2 229 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 FBXW9Q5XUX1 488 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 LETMD1Q6P1Q0 360 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 USP43Q70EL4 1123 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 UBE2J2Q8N2K1 259 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 OR2L13Q8N349 312 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 SPC24Q8NBT2 197 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 TRIM58Q8NG06 486 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 RHEBL1Q8TAI7 183 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 C16orf78Q8WTQ4 265 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 SELENOMQ8WWX9 145 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 MUS81Q96NY9 551 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 GPR78Q96P69 363 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 HIF1ANQ9NWT6 349 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 MCM8Q9UJA3 840 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 PCTPQ9UKL6 214 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-230ENST00000551968 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 FAM159BA6NKW6 160 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ZNF724A8MTY0 619 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 H6PDO95479 791 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ELK4P28324 431 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ZNF117Q03924 483 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 RIN1Q13671 783 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 SLC29A2Q14542 456 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 CBLN3Q6UW01 205 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 SPATA19Q7Z5L4 167 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 GALNT5Q7Z7M9 940 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 GLCCI1Q86VQ1 547 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 CARM1Q86X55 608 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 OR52E4Q8NGH9 312 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 FBXO30Q8TB52 745 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 FBF1Q8TES7 1133 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 PHF21BQ96EK2 531 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 PBKQ96KB5 322 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 BBS4Q96RK4 519 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 GLIPR2Q9H4G4 154 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 EQTNQ9NQ60 294 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 TXNDC16Q9P2K2 825 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ZNF225Q9UK10 706 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 USP22Q9UPT9 525 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 LOC105371242A0A075B767 164 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 PCDH7O60245 1069 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 NGFRP08138 427 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 MPIP34949 423 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 SERPINF1P36955 418 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 MAP3K8P41279 467 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 RAC3P60763 192 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ADIPOQQ15848 244 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 NDUFAF6Q330K2 333 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 GGTA1PQ4G0N0 100 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ZNF662Q6ZS27 426 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 TMEM186Q96B77 213 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ELP4Q96EB1 424 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 SLC6A7Q99884 636 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 EBPLQ9BY08 206 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 PLK3Q9H4B4 646 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 GIMAP4Q9NUV9 329 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 B4DSR2 109 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 PDLIM1O00151 329 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 WNT9BO14905 357 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 KCNH1O95259 989 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 C2P06681 752 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 CRABP2P29373 138 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 SPRP35270 261 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 EIF1P41567 113 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms