RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 OR14L1PQ8NHC6 308 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 RAB8BQ92930 207 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 VPS33AQ96AX1 596 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SLC35G5Q96KT7 338 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 CCDC115Q96NT0 180 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 TIMP4Q99727 224 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SLC35A5Q9BS91 424 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 EXPH5Q8NEV8 1989 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 A0A0G2JND7 137 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 DUXAA6NLW8 204 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 E9PLN8 166 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 RFXANKO14593 260 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 BCKDKO14874 412 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ATP8B1O43520 1251 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ZIC3O60481 467 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 VIMP08670 466 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 IGFBP2P18065 325 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 BMP7P18075 431 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ATP6V1C1P21283 382 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 DPP4P27487 766 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 STARP49675 285 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 STX1BP61266 288 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 C17orf67Q0P5P2 114 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 PMPCAQ10713 525 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 MYBPHQ13203 477 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 GPR68Q15743 365 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 TIGD2Q4W5G0 525 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SAXO2Q658L1 398 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 BIVMQ86UB2 503 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 RNF130Q86XS8 419 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 OR2M3Q8NG83 312 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 OR5M1Q8NGP8 315 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 FBXO27Q8NI29 283 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 NINJ1Q92982 152 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 DMRTA2Q96SC8 542 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SDF2Q99470 211 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 MED4Q9NPJ6 270 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SLC6A13Q9NSD5 602 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 TAS2R10Q9NYW0 307 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 COQ3Q9NZJ6 369 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 CCDC167Q9P0B6 97 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 DKKL1Q9UK85 242 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ABCG2Q9UNQ0 655 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 CAMK2AQ9UQM7 478 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 FAM234BA2RU67 622 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 NKX2-6A6NCS4 301 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ALG1L2C9J202 215 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SCDO00767 359 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 FCMRO60667 390 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SOX30O94993 753 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ANP32DO95626 131 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 HK1P19367 917 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ACVR2AP27037 513 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SRD5A2P31213 254 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ADAM8P78325 824 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SRYQ05066 204 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 GTDC1Q4AE62 458 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 FLYWCH1Q4VC44 716 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 AGKQ53H12 422 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 C6orf10Q5SRN2 563 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 DCST1Q5T197 706 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 VASNQ6EMK4 673 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 RTL6Q6ICC9 239 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 IFNEQ86WN2 208 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 FUNDC1Q8IVP5 155 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 TRIML2Q8N7C3 387 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ZNF614Q8N883 585 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 FADS6Q8N9I5 356 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 NEURL3Q96EH8 262 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ITCHQ96J02 903 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 UGT2B28Q9BY64 529 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 LIME1Q9H400 295 aa8.71□□□□□ -1.02
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