RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 FGF22Q9HCT0 170 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 TAS2R7Q9NYW3 318 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 NTNG1Q9Y2I2 539 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 CHST2Q9Y4C5 530 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 ASXL3Q9C0F0 2248 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 MEIKINA0A087WXM9 373 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 E9PI62 339 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 LILRB5O75023 590 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 UBXN7O94888 489 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 HLA-DPB1P04440 258 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 GNSP15586 552 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 UQCRC2P22695 453 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 IL32P24001 234 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 TRIM23P36406 574 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 E2F1Q01094 437 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 TAP2Q03519 686 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 HSF2Q03933 536 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 IKZF1Q13422 519 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 GSG1Q2KHT4 349 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 TMEM255AQ5JRV8 349 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 SFRP5Q5T4F7 317 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 FAM46CQ5VWP2 391 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 MZT2AQ6P582 158 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 Q6ZTK2 550 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 PRSS45Q7RTY3 260 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 C6orf120Q7Z4R8 191 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 LUZP2Q86TE4 346 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 NXPE2Q96DL1 559 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 DMRTA2Q96SC8 542 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 PPA2Q9H2U2 334 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 OR6C2Q9NZP2 312 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 PTGFRNQ9P2B2 879 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 ASF1AQ9Y294 204 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 A0A087WUU8 490 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 FAM170BA6NMN3 283 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 SLC16A5O15375 505 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 SSNA1O43805 119 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 ATG13O75143 517 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 IFNA7P01567 189 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 WNT1P04628 370 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 ALPPL2P10696 532 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 C5AR1P21730 350 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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THBS3-211ENST00000541990 STK11Q15831 433 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 CD276Q5ZPR3 534 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 ENPP7Q6UWV6 458 aa8.5□□□□□ -1.05
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THBS3-211ENST00000541990 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.5□□□□□ -1.05
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THBS3-211ENST00000541990 ZFP3Q96NJ6 502 aa8.5□□□□□ -1.05
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THBS3-211ENST00000541990 GPR174Q9BXC1 333 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 GSX2Q9BZM3 304 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 DPAGT1Q9H3H5 408 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 AUNIPQ9H7T9 357 aa8.5□□□□□ -1.05
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THBS3-211ENST00000541990 SOX30O94993 753 aa8.49□□□□□ -1.05
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THBS3-211ENST00000541990 SULT1A4P0DMN0 295 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 DRD2P14416 443 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 NPPBP16860 134 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 PITPNBP48739 271 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 TDGQ13569 410 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 ENPP2Q13822 863 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 SMARCD3Q6STE5 483 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 FAM92BQ6ZTR7 304 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 OR51G2Q8NGK0 314 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 OR8K5Q8NH50 307 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 OR51Q1Q8NH59 317 aa8.49□□□□□ -1.05
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