RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530170.1

RPS3-215, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 5

Gene RPS3, Length 531 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-215ENST00000530170 POMT2Q9UKY4 750 aa8.5□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa8.5□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 ZZEF1O43149 2961 aa8.5□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.5□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 A0A0B4J2E0 115 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 A0A1B0GX12 115 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 A0A1W2PS29 197 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 OR5K3A6NET4 321 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 LILRA5A6NI73 299 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 NPIPB9F8W1W9 429 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 CTDSP2O14595 271 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 ZNF749O43361 778 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 ATP6V1G1O75348 118 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 CDRT1O95170 752 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 SEMA4FO95754 770 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 DLGAP3O95886 979 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 TNFP01375 233 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 IL7P13232 177 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 TBXA2RP21731 343 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 DRD5P21918 477 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 AK4P27144 223 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 HTR2AP28223 471 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 CASP3P42574 277 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 AVPR1BP47901 424 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 BLKP51451 505 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 TPMTP51580 245 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 SELENBP1Q13228 472 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 TCEA2Q15560 299 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 ZNF141Q15928 474 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 LPAL2Q16609 132 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 PRTGQ2VWP7 1150 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 AMZ1Q400G9 498 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 DEFB134Q4QY38 66 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 FLYWCH1Q4VC44 716 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 HACD4Q5VWC8 232 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 DESI1Q6ICB0 168 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 MZT2AQ6P582 158 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 PAQR6Q6TCH4 344 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 GDPD3Q7L5L3 318 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 NKAIN4Q8IVV8 208 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 ACBD7Q8N6N7 88 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 CSNK1A1LQ8N752 337 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 TEX19Q8NA77 164 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 IL17RDQ8NFM7 739 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 GPR151Q8TDV0 419 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 TMEM239Q8WW34 195 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 CNPPD1Q9BV87 410 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 SLC19A3Q9BZV2 496 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 FOXQ1Q9C009 403 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 TRIM2Q9C040 744 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 SLC22A4Q9H015 551 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 TMEM168Q9H0V1 697 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 MIXL1Q9H2W2 232 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 OR52D1Q9H346 318 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 CNIH4Q9P003 139 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 CPNE7Q9UBL6 633 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 OR6C74A6NCV1 312 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 EFCAB7A8K855 629 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 SGK494L7N484 410 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 RGS13O14921 159 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 PLD2O14939 933 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 FGF17O60258 216 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 FCMRO60667 390 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 SLC19A2O60779 497 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 CBX7O95931 251 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 BMP7P18075 431 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 PAICSP22234 425 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 F8A1P23610 371 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 LCN1P31025 176 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 TPTEP56180 551 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 GGTLC2Q14390 218 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 OR1Q1Q15612 314 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3-215ENST00000530170 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.052e-10■□□□□ 9.7
RPS3-215ENST00000530170 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms