RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519889.5

CCNE2-204, Transcript of cyclin E2, human

TSL 5

Gene CCNE2, Length 434 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNE2-204	ENST00000519889	GALK2	Q01415	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	SPHAR	Q15513	63 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	STX1A	Q16623	288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889		Q6ZSR6	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889		Q6ZSR9	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	PARG	Q86W56	976 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	LRR1	Q96L50	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	PKP2	Q99959	881 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	PIGV	Q9NUD9	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	RNF103	O00237	685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	EPO	P01588	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	SLC4A1	P02730	911 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	SP1	P08047	785 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	B4GALT1	P15291	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	GLRA2	P23416	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	HLA-F	P30511	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	ARL2	P36404	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	CCR4	P51679	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	TDGF1P3	P51864	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	HAND2	P61296	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	BTG1	P62324	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	SPAG1	Q07617	926 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	PDK1	Q15118	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	SLC43A2	Q8N370	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	OR6S1	Q8NH40	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	MAGED4	Q96JG8	741 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	SSX3	Q99909	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	KRT87P	A6NCN2	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	IDS	B3KWA1	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	SURF4	O15260	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	COCH	O43405	550 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	PRPSAP2	O60256	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	PTMS	P20962	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	IDS	P22304	550 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	CASP14	P31944	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	LIMK2	P53671	638 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	NEK5	Q6P3R8	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	TMEM64	Q6YI46	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889		Q6ZVQ6	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNE2-204	ENST00000519889	NLRP14	Q86W24	1093 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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