RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ACVR1Q04771 509 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C17orf67Q0P5P2 114 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BNIP1Q12981 228 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MPPE1Q53F39 396 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PARP10Q53GL7 1025 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CT45A2Q5DJT8 189 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C1orf146Q5VVC0 180 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FRMPD2BQ6IN97 320 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ASPGQ86U10 573 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM135Q86UB9 458 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AQP12AQ8IXF9 295 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LRRC52Q8N7C0 313 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NKAPP1Q8N9T2 125 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARPC1AQ92747 370 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GGHQ92820 318 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 L3HYPDHQ96EM0 354 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR2A5Q96R48 311 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SRXN1Q9BYN0 137 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MIS18AQ9NYP9 233 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MBD2Q9UBB5 411 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR12D3Q9UGF7 316 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPR132Q9UNW8 380 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM5Q9Y2B1 443 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PTPRUQ92729 1446 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PLAC8L1A1L4L8 177 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LRIT2A6NDA9 550 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KBTBD13C9JR72 458 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NPIPA2E9PIF3 369 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 H3BMH7 237 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF263O14978 683 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AHCYL1O43865 530 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM58BPP0C7Q3 252 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CAPN3P20807 821 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NNMTP40261 264 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TNFSF9P41273 254 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UBE2AP49459 152 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PPP5CP53041 499 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CDKL1Q00532 357 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 WASHC5Q12768 1159 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NPRL3Q12980 569 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PLD1Q13393 1074 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CUL4AQ13619 759 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IHHQ14623 411 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC5A12Q1EHB4 618 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VAX1Q5SQQ9 334 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CST9LP1Q5W188 147 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM91A1Q658Y4 838 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HACD2Q6Y1H2 254 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 STAC2Q6ZMT1 411 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM136Q6ZRR5 245 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CNTN4Q8IWV2 1026 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF683Q8IZ20 524 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SFRP1Q8N474 314 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR6M1Q8NGM8 313 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR10G4Q8NGN3 311 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DTX3LQ8TDB6 740 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ULK4Q96C45 1275 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SULT4A1Q9BR01 284 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM114A2Q9NRY5 505 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KIF25Q9UIL4 384 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SIGLEC7Q9Y286 467 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CARMIL3Q8ND23 1372 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ESYT2A0FGR8 921 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SDR42E2A6NKP2 422 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLHL2O95198 593 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 JCHAINP01591 159 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TDGF1P13385 188 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HRES1P13985 223 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TCP1P17987 556 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RFC2P35250 354 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ACADSBP45954 432 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SGSHP51688 502 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TDGF1P3P51864 188 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TAS2R19P59542 299 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ESRRGP62508 458 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SMARCB1Q12824 385 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KARSQ15046 597 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms