RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	GPR151	Q8TDV0	419 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	RIT1	Q92963	219 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	UBE2F	Q969M7	185 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	DGAT2	Q96PD7	388 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	RASSF1	Q9NS23	344 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	LANCL2	Q9NS86	450 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	AASS	Q9UDR5	926 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MED13	Q9UHV7	2174 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SOCS6	O14544	535 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	AP3D1	O14617	1153 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	KIAA0513	O60268	411 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CHM	P24386	653 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	GALNS	P34059	522 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	GABRA3	P34903	492 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	KRT20	P35900	424 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	STT3A	P46977	705 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC35A2	P78381	396 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	BTG2	P78543	158 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	TRAM2	Q15035	370 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MED25	Q71SY5	747 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MORN4	Q8NDC4	146 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PIK3R3	Q92569	461 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	AHCYL1	O43865	530 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CYP7B1	O75881	506 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SEC14L2	O76054	403 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	OR5F1	O95221	314 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	GABRB1	P18505	474 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	GSS	P48637	474 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CDC42	P60953	191 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PIGF	Q07326	219 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	COX10	Q12887	443 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SERTAD2	Q14140	314 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	GPR68	Q15743	365 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	LINC00303	Q3SY05	128 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	P3H2	Q8IVL5	708 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	THAP4	Q8WY91	577 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	TTC9	Q92623	222 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	DIO2	Q92813	273 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	TSLP	Q969D9	159 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC38A4	Q969I6	547 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MUL1	Q969V5	352 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	OR1F2P	Q96R84	312 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	FRS3	O43559	492 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	RGS10	O43665	173 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MPZL2	O60487	215 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	TPST2	O60704	377 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM87A	P0C7U9	286 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MAOA	P21397	527 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PCMT1	P22061	227 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	DCK	P27707	260 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	IFNGR2	P38484	337 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	RHAG	Q02094	409 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ST3GAL3	Q11203	375 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SVOP	Q8N4V2	548 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MCHR1	Q99705	422 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		13.46	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms