RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CXCL11O14625 94 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 CRLF1O75462 422 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 PALMO75781 387 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35E2P0CK97 266 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 UFSP1Q6NVU6 142 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC80Q76M96 950 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 NLRP9Q7RTR0 991 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC50Q8IVM0 306 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 OR1F12Q8NHA8 337 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 RHOXF1Q8NHV9 184 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 PIGCQ92535 297 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 RANBP9Q96S59 729 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 EDEM2Q9BV94 578 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 CAB39LQ9H9S4 337 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 LCMT1Q9UIC8 334 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 RASD1Q9Y272 281 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 PNPLA6Q8IY17 1366 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 G3V4G9 280 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 PRRG1O14668 218 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 SCRG1O75711 98 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 PNMTP11086 282 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 LAP3P28838 519 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 NMT1P30419 496 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 FGL1Q08830 312 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 TIGITQ495A1 244 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 TPRA1Q86W33 373 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 VSTM4Q8IW00 320 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 UBQLNLQ8IYU4 475 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 SLC39A11Q8N1S5 342 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 PSMG2Q969U7 264 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 PELI1Q96FA3 418 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 COQ2Q96H96 371 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 FOXN4Q96NZ1 517 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 SLC39A3Q9BRY0 314 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF385DQ9H6B1 395 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 SLC17A5Q9NRA2 495 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 SPRR3Q9UBC9 169 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 HPCAL4Q9UM19 191 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC4AQ9UMR7 237 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 PP2D1A8MPX8 630 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 FCN1O00602 326 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 TAPBPO15533 448 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF208O43345 1280 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 SURF6O75683 361 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 CD80P33681 288 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 GRIA1P42261 906 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 P2RY1P47900 373 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 AIF1P55008 147 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 CXCL6P80162 114 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 MAJINQ3KP22 176 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 ATAD3CQ5T2N8 411 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 BEND3Q5T5X7 828 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 OR5M10Q6IEU7 315 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM123Q8N131 208 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC4FQ8N1N0 589 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 BHLHE23Q8NDY6 225 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 BADQ92934 168 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM43Q9BTV4 400 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 CAPS2Q9BXY5 557 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 SMYD3Q9H7B4 428 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 MIEF1Q9NQG6 463 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 NUDT15Q9NV35 164 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 SCML2Q9UQR0 700 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 USP16Q9Y5T5 823 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 DHRS7CA6NNS2 312 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 IMPDH1P20839 514 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 YWHABP31946 246 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 ZMYND11Q15326 602 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 MARC1Q5VT66 337 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 LIPNQ5VXI9 398 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 WSCD1Q658N2 575 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 KIR3DL3Q8N743 410 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 OR51G2Q8NGK0 314 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 PPIAL4AQ9Y536 164 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 KANK1Q14678 1352 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 E7ESA3 106 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 RS1O15537 224 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 BCL2L11O43521 198 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 GPX5O75715 221 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 PGK1P00558 417 aa5.84□□□□□ -1.47
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