RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489095.1

TRBV5-2-201, Transcript of T cell receptor beta variable 5-2 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV5-2, Length 273 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC35F4A4IF30 521 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 TMEM150CB9EJG8 249 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 CDC42EP2O14613 210 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 DUX1O43812 170 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 DNAJB6O75190 326 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 PIAS2O75928 621 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 APOA1P02647 267 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 HLA-DPB1P04440 258 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 WNT1P04628 370 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 MSL3P1P0C860 447 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 LIMS3P0CW19 117 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 LIMS4P0CW20 117 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 SAGP10523 405 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 PNMTP11086 282 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 CKMT1AP12532 417 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 PEPDP12955 493 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 PRG2P13727 222 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 ZNF3P17036 446 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 ATP6V1E1P36543 226 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 TGFBR1P36897 503 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 ADH7P40394 386 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 RANBP1P43487 201 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 FNTBP49356 437 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 ARL4DP49703 201 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 STARD6P59095 220 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 GPLD1P80108 840 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 HSD11B2P80365 405 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 FOXK2Q01167 660 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 TRAM1Q15629 374 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 WDR45BQ5MNZ6 344 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 PDZK1Q5T2W1 519 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 LCN1P1Q5VSP4 162 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 LIPKQ5VXJ0 399 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 NIPAL3Q6P499 406 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 FIGNL1Q6PIW4 674 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 HSDL2Q6YN16 418 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 RTL4Q6ZR62 310 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 SFTPA2Q8IWL1 248 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 ZNF485Q8NCK3 441 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 SIMC1Q8NDZ2 872 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 OR4C6Q8NH72 309 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 RLN3Q8WXF3 142 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 TMCO6Q96DC7 493 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 PEX11GQ96HA9 241 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 ART5Q96L15 291 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 CNPPD1Q9BV87 410 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 IFT27Q9BW83 186 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 PRR14Q9BWN1 585 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 DPH1Q9BZG8 443 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 STARD5Q9NSY2 213 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 TMEM74BQ9NUR3 256 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 IRAK4Q9NWZ3 460 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 RHBDL2Q9NX52 303 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 ERVK13-1Q9NX77 482 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 KCNE5Q9UJ90 142 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 KLHL21Q9UJP4 597 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 CBLCQ9ULV8 474 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 CA14Q9ULX7 337 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 POLHQ9Y253 713 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 SIGLEC7Q9Y286 467 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 NTNG1Q9Y2I2 539 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 GPR52Q9Y2T5 361 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 OR10H1Q9Y4A9 318 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 THADAQ6YHU6 1953 aa5.49□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 CEP192Q8TEP8 1941 aa5.49□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 SERINC4A6NH21 518 aa5.49□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.49□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 MAGEB3O15480 346 aa5.49□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 HCRTR1O43613 425 aa5.49□□□□□ -1.53
TRBV5-2-201ENST00000489095 IDH3BO43837 385 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms