RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488426.5

NELFE-209, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 1,855 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-209ENST00000488426 SLC39A7Q92504 469 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 TTC9Q92623 222 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 SLC41A3Q96GZ6 507 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 TAAR9Q96RI9 348 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 SLX1AQ9BQ83 275 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 ZNF559Q9BR84 538 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 ZPBPQ9BS86 351 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 CRB3Q9BUF7 120 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 ULBP3Q9BZM4 244 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 SPRY4Q9C004 299 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 WWTR1Q9GZV5 400 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 CTPS2Q9NRF8 586 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 TRAPPC13A5PLN9 417 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 C9J4A7 227 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 LIPCP11150 499 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 RPP38P78345 283 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 COX10Q12887 443 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 DCAF12Q5T6F0 453 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 LCN10Q6JVE6 187 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 KLHL17Q6TDP4 642 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 TMEM205Q6UW68 189 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 ISLR2Q6UXK2 745 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 CD300LDQ6UXZ3 194 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 ZNF614Q8N883 585 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 B3GNT7Q8NFL0 401 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 TSPAN14Q8NG11 270 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 NKD1Q969G9 470 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 HSPBAP1Q96EW2 488 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 GAL3ST4Q96RP7 486 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 UCK2Q9BZX2 261 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 UBQLN4Q9NRR5 601 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 ZNF462Q96JM2 2506 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 A0A087WUU8 490 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 SERINC4A6NH21 518 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 OSMP13725 252 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 EPHA2P29317 976 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 GGT2P36268 569 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 ADH7P40394 386 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 HOXC5Q00444 222 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 PLAURQ03405 335 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 CD47Q08722 323 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 KLHL26Q53HC5 615 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 C1orf94Q6P1W5 598 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 ZNF613Q6PF04 617 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 FAM198BQ6UWH4 519 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 ZNF550Q7Z398 422 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 GDF7Q7Z4P5 450 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 ZNF440Q8IYI8 595 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 ZNF441Q8N8Z8 693 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 LPAR4Q99677 370 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 PRR14Q9BWN1 585 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 YIPF3Q9GZM5 350 aa11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 CLPTM1O96005 669 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 CD63P08962 238 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 GKN3PP0CG01 181 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 PRG2P13727 222 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 POU2F1P14859 743 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 GSTM3P21266 225 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 HTR2AP28223 471 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 KRT20P35900 424 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 TUBA4AP68366 448 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 IL5RAQ01344 420 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 OR1Q1Q15612 314 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 C6orf141Q5SZD1 244 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 ZNF730Q6ZMV8 503 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 RRM2BQ7LG56 351 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 SLC34A3Q8N130 599 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 OR4C3Q8NH37 302 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 MR1Q95460 341 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 TP53INP1Q96A56 240 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 VMP1Q96GC9 406 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 COL6A6A6NMZ7 2263 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 A0A087WXM4 84 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 DPPA5A6NC42 116 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
NELFE-209ENST00000488426 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms