RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 ARHGDIGQ99819 225 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 FAM173AQ9BQD7 235 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 PTGES2Q9H7Z7 377 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 IL1RAPQ9NPH3 570 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 ARMC1Q9NVT9 282 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 TMEM229AB2RXF0 380 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 H0YHG0 523 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 AP3D1O14617 1153 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 NME2P1O60361 137 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 CBR3O75828 277 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 AGFG2O95081 481 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 OPN1SWP03999 348 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 SEMG1P04279 462 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 SP1P08047 785 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 CCL3P10147 92 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 THRBP10828 461 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 FCGR1AP12314 374 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 PGCP20142 388 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 NME2P22392 152 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 MAGEA2P43356 314 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 UQCRFS1P47985 274 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 TNFSF10P50591 281 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 SMIM11AP58511 58 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 KLRB1Q12918 225 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 SKP2Q13309 424 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 CBFBQ13951 182 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 CCNIQ14094 377 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 GANABQ14697 944 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 INAQ16352 499 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 APOOLQ6UXV4 268 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 MARCH3Q86UD3 253 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 ZNF227Q86WZ6 799 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 ADGRG5Q8IZF4 528 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 AMER2Q8N7J2 671 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 SMYD1Q8NB12 490 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 GPR32P1Q8NGA4 272 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 OR5W2Q8NH69 310 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 SLC47A1Q96FL8 570 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 SCMH1Q96GD3 660 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 ZNF559Q9BR84 538 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 TRIM2Q9C040 744 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 SH3GLB1Q9Y371 365 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 A0A087WZY1 265 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 ANKUB1A6NFN9 424 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 NPIPA7E9PJI5 369 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 K7EM74 188 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 SNPHO15079 494 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 HCRTR2O43614 444 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 SCO2O43819 266 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 TPST1O60507 370 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 FABP3P05413 133 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 NPIPA8P0DM63 369 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 RHCEP18577 417 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 PTGDSP41222 190 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 MAP2K6P52564 334 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 COPZ1P61923 177 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 RAPSNQ13702 412 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 CD226Q15762 336 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 ZNF766Q5HY98 468 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 TIGD3Q6B0B8 471 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 SPINK14Q6IE38 97 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 OLIG3Q7RTU3 272 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 MDGA2Q7Z553 956 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 CARM1Q86X55 608 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 PLCZ1Q86YW0 608 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 CLIP4Q8N3C7 705 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 LSMEM1Q8N8F7 131 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 TEX19Q8NA77 164 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 OR1J4Q8NGS1 313 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 DUSP19Q8WTR2 217 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 CANT1Q8WVQ1 401 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 TMEM234Q8WY98 164 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 C7orf34Q96L11 122 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 ZNF597Q96LX8 424 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 QPCTLQ9NXS2 382 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 FLRT3Q9NZU0 649 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-211ENST00000488243 B4GALT7Q9UBV7 327 aa10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms