RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 DNAJA2O60884 412 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 CRATP43155 626 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 ZNF136P52737 540 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 HPCAP84074 193 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 SKP2Q13309 424 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 METTL21CQ5VZV1 264 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 HMGN2P46Q86SG4 172 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 GGNQ86UU5 652 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 ACBD4Q8NC06 268 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 OR5W2Q8NH69 310 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 RUBCNLQ9H714 662 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 UNC79Q9P2D8 2635 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PP18 115 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 CLIC1O00299 241 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 SEC14L5O43304 696 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 CSTAP01040 98 aa18.87■□□□□ 0.61
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ACTB-211ENST00000480301 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP18.87■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 NR2F1P10589 423 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 PGM1P36871 562 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 MDH1P40925 334 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
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ACTB-211ENST00000480301 RGNQ15493 299 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 METTL25Q8N6Q8 603 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 FAM71CQ8NEG0 241 aa18.87■□□□□ 0.61
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ACTB-211ENST00000480301 SMPDL3BQ92485 455 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 ENKD1Q9H0I2 346 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 AGAP5A6NIR3 686 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 EFNA2O43921 213 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 RCBTB2O95199 551 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 NUDT14O95848 222 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 TGM6O95932 706 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 TFPTP0C1Z6 253 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 PRKCAP17252 672 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 IL11P20809 199 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 EIF1P41567 113 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 ARFIP2P53365 341 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 DSTNP60981 165 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 RAC1P63000 192 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 KCNJ10P78508 379 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 PLAURQ03405 335 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 CHMP1BQ7LBR1 199 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 SLC38A5Q8WUX1 472 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 FIG4Q92562 907 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 ADGRG7Q96K78 797 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 TM9SF2Q99805 663 aa18.86■□□□□ 0.61
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ACTB-211ENST00000480301 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 P2RX2Q9UBL9 471 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 PKDREJQ9NTG1 2253 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 CLDN24A6NM45 220 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 DVL2O14641 736 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 CYP7B1O75881 506 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 NTN1O95631 604 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 OPN1LWP04000 364 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 NUDT7P0C024 238 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 BMP5P22003 454 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 CTSSP25774 331 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 ADH6P28332 368 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 CCR4P51679 360 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP18.85■□□□□ 0.617e-7■■■□□ 18.3
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ACTB-211ENST00000480301 CBFBQ13951 182 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A53Q5H9E4 307 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 PMM1Q92871 262 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 MARVELD3Q96A59 401 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 SPOCK3Q9BQ16 436 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 PINK1Q9BXM7 581 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 VAPAQ9P0L0 249 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 STOML1Q9UBI4 398 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 GMEB1Q9Y692 573 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 DOCK7Q96N67 2140 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A20A6NK97 555 aa18.84■□□□□ 0.61
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