RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 SERPINB9P50453 376 aa7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 PRKAA2P54646 552 aa7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF763Q0D2J5 394 aa7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 SLC29A2Q14542 456 aa7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 KIAA0040Q15053 153 aa7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
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CTPS1-208ENST00000479480 C6orf52Q5T4I8 152 aa7.47□□□□□ -1.21
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CTPS1-208ENST00000479480 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.47□□□□□ -1.21
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CTPS1-208ENST00000479480 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa7.47□□□□□ -1.21
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CTPS1-208ENST00000479480 ACTRT2Q8TDY3 377 aa7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 RNF128Q8TEB7 428 aa7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 KLHL15Q96M94 604 aa7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 GSTO2Q9H4Y5 243 aa7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 CXorf36Q9H7Y0 433 aa7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 FANCFQ9NPI8 374 aa7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 NPAP1Q9NZP6 1156 aa7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 STOML1Q9UBI4 398 aa7.47□□□□□ -1.21
CTPS1-208ENST00000479480 ATRQ13535 2644 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF195O14628 629 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 LYZL6O75951 148 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 PRKD3O94806 890 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 SLITRK5O94991 958 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 YES1P07947 543 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 NGFRP08138 427 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 TAC1P20366 129 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 FOXF1Q12946 379 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 HSPB3Q12988 150 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 ITGADQ13349 1161 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 P2RY6Q15077 328 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 DUSP5Q16690 384 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 PDSS1Q5T2R2 415 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 NOXRED1Q6NXP6 359 aa7.46□□□□□ -1.22
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CTPS1-208ENST00000479480 FCRLAQ7L513 359 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 DTX2Q86UW9 622 aa7.46□□□□□ -1.22
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CTPS1-208ENST00000479480 RELL1Q8IUW5 271 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 BANPQ8N9N5 519 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 FBXO27Q8NI29 283 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 HS6ST2Q96MM7 605 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 C3orf14Q9HBI5 128 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 MID1IP1Q9NPA3 183 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 MYNNQ9NPC7 610 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 NGBQ9NPG2 151 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 MIEF1Q9NQG6 463 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 KLHL13Q9P2N7 655 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 CCL27Q9Y4X3 112 aa7.46□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 TTC36A6NLP5 189 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 GOLGA8RI6L899 631 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 AKAP10O43572 662 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 NPIPA8P0DM63 369 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 IGHV1-2P23083 117 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 NTSP30990 170 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 CASQ1P31415 396 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 GSTM5P46439 218 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 PKNOX1P55347 436 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF117Q03924 483 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 LCP2Q13094 533 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-208ENST00000479480 PPA1Q15181 289 aa7.45□□□□□ -1.22
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