RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 RAC1P63000 192 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 SKP2Q13309 424 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 CBFBQ13951 182 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 MAPRE2Q15555 327 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC25A53Q5H9E4 307 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 COQ5Q5HYK3 327 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 PEX5LQ8IYB4 626 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 MEIOBQ8N635 442 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 OR5M1Q8NGP8 315 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 KLHDC3Q9BQ90 382 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TUBA1CQ9BQE3 449 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 PCNX3Q9H6A9 2034 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0G2JNJ9 132 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 A1L4Q6 167 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 GMNCA6NCL1 334 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 HSPB2A8KAH6 182 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC22O60826 627 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TOXO94900 526 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 NUDT14O95848 222 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 NPPAP01160 153 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 NUDT7P0C024 238 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 LSP1P33241 339 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 SEC24CP53992 1094 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 CLDN15P56746 228 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 SRYQ05066 204 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 HSPB2Q16082 182 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 ZSWIM7Q19AV6 140 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 NDUFAF6Q330K2 333 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 DHDDSQ86SQ9 333 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 POC1BQ8TC44 478 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 WNT2BQ93097 391 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM19Q96HH6 336 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 MRGPRX4Q96LA9 322 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD27Q96NW4 1050 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIB1Q96RU8 372 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 CGREF1Q99674 301 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM38AQ9H6F2 299 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 Q9UFV3 132 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 BBIP1A8MTZ0 92 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 H3BML4 177 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 NTN1O95631 604 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 IL2RAP01589 272 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 BCHEP06276 602 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 NID1P14543 1247 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 IL7RP16871 459 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 PRKCAP17252 672 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 PGCP20142 388 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 ELK4P28324 431 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC6A8P48029 635 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 DLX5P56178 289 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 NFYCQ13952 458 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 GCNT6Q5T4J0 391 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 CHMP1BQ7LBR1 199 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 SPATA21Q7Z572 469 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM234Q8WY98 164 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF145Q96MT1 663 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 CHST11Q9NPF2 352 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF232Q9UNY5 417 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 IFT52Q9Y366 437 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 ICE1Q9Y2F5 2266 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 PCNX1Q96RV3 2341 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 CLCA1A8K7I4 914 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 SHISA8B8ZZ34 492 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 FBP2O00757 339 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 ADAMDEC1O15204 470 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP7B1O75881 506 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 PGM3O95394 542 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 THBS1P07996 1170 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 ARAFP10398 606 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 HTR1EP28566 365 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 QPRTQ15274 297 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 CDSNQ15517 529 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms