RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	NDUFB5	O43674	189 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	NGFR	P08138	427 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	HPGD	P15428	266 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	PRPS1L1	P21108	318 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	ME2	P23368	584 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	LCN1	P31025	176 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	CCKAR	P32238	428 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	CLDN8	P56748	225 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	SQLE	Q14534	574 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF550	Q7Z398	422 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	STK32C	Q86UX6	486 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	MISP	Q8IVT2	679 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	PPCDC	Q96CD2	204 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	SMR3A	Q99954	134 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	GLRX2	Q9NS18	164 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	VDAC3	Q9Y277	283 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	ALG1L2	C9J202	215 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	SIAH2	O43255	324 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	GMFG	O60234	142 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	TBX19	O60806	448 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	CCDC22	O60826	627 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC22A3	O75751	556 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	NKX2-2	O95096	273 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	SYNGR4	O95473	234 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	ATP4B	P51164	291 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	PRKAG1	P54619	331 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	UFM1	P61960	85 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	GUSBP1	Q15486	140 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	PGS1	Q32NB8	556 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	BEX5	Q5H9J7	111 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	CPTP	Q5TA50	214 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	SZRD1	Q7Z422	152 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	GGN	Q86UU5	652 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	NUP43	Q8NFH3	380 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	PIK3R3	Q92569	461 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC9A6	Q92581	669 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG11-208	ENST00000437028	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	C7orf72	A4D263	438 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028		C9JVG2	144 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	SCD	O00767	359 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	ANKRD28	O15084	1053 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	TMCC2	O75069	709 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	AQP8	O94778	261 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	LAMP1	P11279	417 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	IL11	P20809	199 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	NR1H2	P55055	460 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	RAC1	P63000	192 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	BEND4	Q6ZU67	534 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	OR10D3	Q8NH80	312 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	MTERF3	Q96E29	417 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	PERP	Q96FX8	193 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028		Q96MF0	132 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	MRGBP	Q9NV56	204 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028		H7C1Q1	480 aa		13.82	□□□□□ -0.2

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