RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM71CQ8NEG0 241 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPR32P1Q8NGA4 272 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR5W2Q8NH69 310 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DUSP19Q8WTR2 217 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RNF138Q8WVD3 245 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM234Q8WY98 164 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF347Q96SE7 839 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARHGDIGQ99819 225 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIM2Q9C040 744 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SH2D2AQ9NP31 389 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IL1RAPQ9NPH3 570 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RLIMQ9NVW2 624 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRDM4Q9UKN5 801 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AP4S1Q9Y587 144 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EXPH5Q8NEV8 1989 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGF2RP11717 2491 aa9.37□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DOCK10Q96BY6 2186 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ANKUB1A6NFN9 424 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 hCG_2039718K7EN88 272 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADAMDEC1O15204 470 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PEX1O43933 1283 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GMFGO60234 142 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ENTPD5O75356 428 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GKN3PP0CG01 181 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GP1BBP13224 206 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TNFRSF1BP20333 461 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNASE1L1P49184 302 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMIM11AP58511 58 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPR85P60893 370 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EPS8Q12929 822 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NDUFAF6Q330K2 333 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AAGABQ6PD74 315 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 APOOLQ6UXV4 268 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ASB18Q6ZVZ8 466 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC22A16Q86VW1 577 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CADM2Q8N3J6 435 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM86B1Q8N7N1 296 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR2M7Q8NG81 312 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RNF217Q8TC41 542 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PYDC1Q8WXC3 89 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRRC1Q96M27 445 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MCHR1Q99705 422 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FNDC11Q9BVV2 318 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHID1Q9BWS9 393 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ENPP4Q9Y6X5 453 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FRYQ5TBA9 3013 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A087WZY1 265 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAAHO00519 579 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FRS3O43559 492 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 E2F6O75461 281 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CBR3O75828 277 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CST1P01037 141 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LDLRP01130 860 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM87AP0C7U9 286 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RHCEP18577 417 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FASP25445 335 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GDF1P27539 372 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTGDSP41222 190 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HTR3AP46098 478 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MEOX1P50221 254 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GAS1P54826 345 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPIBQ01892 262 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 INAQ16352 499 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TIGD3Q6B0B8 471 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WBP2NLQ6ICG8 309 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR5M10Q6IEU7 315 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF613Q6PF04 617 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SULF2Q8IWU5 870 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PIK3C3Q8NEB9 887 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR6T1Q8NGN1 323 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ST8SIA1Q92185 356 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SDCCAG3Q96C92 435 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SCMH1Q96GD3 660 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FRMD6Q96NE9 622 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PIP5K1AQ99755 562 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DSN1Q9H410 356 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRORYQ9H606 182 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 REEP1Q9H902 201 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 S100A14Q9HCY8 104 aa9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms