RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 NICN1Q9BSH3 213 aa2.92□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 ZNF416Q9BWM5 594 aa2.92□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 DUSP16Q9BY84 665 aa2.92□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 CHIAQ9BZP6 476 aa2.92□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 ASB8Q9H765 288 aa2.92□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 WDR45Q9Y484 360 aa2.92□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 OARD1Q9Y530 152 aa2.92□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 CLDN5O00501 218 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 CTAGE5O15320 804 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 TIMP1P01033 207 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 FUT3P21217 361 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 CALB2P22676 271 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 PSMA2P25787 234 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 NTSP30990 170 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 KIR2DS2P43631 304 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 GNB2P62879 340 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 CUL1Q13616 776 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 SLC5A12Q1EHB4 618 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 USH1GQ495M9 461 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 ATF7IP2Q5U623 682 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 DNM1P46Q6ZS02 220 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 KIAA1328Q86T90 577 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 PPP1R27Q86WC6 154 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 SKA3Q8IX90 412 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 ZNF100Q8IYN0 542 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 ALLCQ8N6M5 410 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 MYLPFQ96A32 169 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 FAHD2AQ96GK7 314 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 SMIM14Q96QK8 99 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 POLE3Q9NRF9 147 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 HPF1Q9NWY4 346 aa2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RBM39-211ENST00000426951 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 K7N7A8 449 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 CA1P00915 261 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 AQP1P29972 269 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 MDH1P40925 334 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 CAV2P51636 162 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 SLC10A7Q0GE19 358 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 RAB40BQ12829 278 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 LIPNQ5VXI9 398 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 OTPQ5XKR4 325 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 TMEM110Q86TL2 294 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 LCA5Q86VQ0 697 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 C15orf54Q8N8G6 183 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 FADS6Q8N9I5 356 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 DENND6BQ8NEG7 585 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 OR51G2Q8NGK0 314 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 TAF4BQ92750 862 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 CYYR1Q96J86 154 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 MCHR1Q99705 422 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 TXN2Q99757 166 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 SLC6A7Q99884 636 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 RNF126Q9BV68 326 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 GLIPR2Q9H4G4 154 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 MARCH5Q9NX47 278 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 CD274Q9NZQ7 290 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 PLLPQ9Y342 182 aa2.9□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 PP2D1A8MPX8 630 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 K7EPI3 171 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 SULT2B1O00204 365 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 MAPK13O15264 365 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ZNF264O43296 627 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 OR1F1O43749 312 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 SMPD2O60906 423 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP5-8O75690 187 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 MMP23AO75900 390 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 NEBLO76041 1014 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 TM7SF2O76062 418 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 IGLV1-47P01700 117 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 KRT6BP04259 564 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ASNSP08243 561 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 HTR2AP28223 471 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 HOXD10P28358 340 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 KRT6CP48668 564 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 RIPK4P57078 832 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 IL17AQ16552 155 aa2.89□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 CFAP221Q4G0U5 840 aa2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms