RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 FKBP10Q96AY3 582 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 VPS50Q96JG6 964 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 BBS4Q96RK4 519 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 DOHHQ9BU89 302 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 KLHL31Q9H511 634 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 PDP2Q9P2J9 529 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 KCND3Q9UK17 655 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 BAG5Q9UL15 447 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 PSME2Q9UL46 239 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 DAPP1Q9UN19 280 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 SNX8Q9Y5X2 465 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 COL6A5A8TX70 2615 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 A0A0G2JN53 185 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 A0A1W2PQM1 296 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 H0YAE9 185 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 UPK1AO00322 258 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 SOCS2O14508 198 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 ADAMDEC1O15204 470 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 ACOX3O15254 700 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 PPM1DO15297 605 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 PROM1O43490 865 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 E2F6O75461 281 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 BMP10O95393 424 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 AGR2O95994 175 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 ALPLP05186 524 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 LYNP07948 512 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 PRKAR1AP10644 381 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 ALPPL2P10696 532 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 ITGA2P17301 1181 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 FPR1P21462 350 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 CPN2P22792 545 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 MPIP34949 423 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 PRIM2P49643 509 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 CRYBA2P53672 197 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 CRISP3P54108 245 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 LIM2P55344 173 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 NRG3P56975 720 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 RAB38P57729 211 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 RAB8AP61006 207 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 BTN3A2P78410 334 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 PPP2R2BQ00005 443 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 C1orf61Q13536 156 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 TP53BP2Q13625 1128 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 NRF1Q16656 503 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 NDUFA9Q16795 377 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 DEFB133Q30KQ1 61 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 DEFB134Q4QY38 66 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 TCTE1Q5JU00 501 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 TOR2AQ5JU69 321 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 OR2T5Q6IEZ7 315 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 KRT80Q6KB66 452 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 REEP3Q6NUK4 255 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 PRSS42Q7Z5A4 293 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 AMER3Q8N944 861 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 TEX19Q8NA77 164 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 OR2T29Q8NH02 315 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 SUN3Q8TAQ9 357 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 TMBIM1Q969X1 311 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 TAMM41Q96BW9 452 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 NRBF2Q96F24 287 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 C10orf90Q96M02 699 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 ZNF347Q96SE7 839 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms