RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 C7orf72A4D263 438 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 AGAP5A6NIR3 686 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CD8B2A6NJW9 211 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 FIGNL2A6NMB9 653 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 FAM90A27PA6NNH2 459 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CLCA1A8K7I4 914 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM229AB2RXF0 380 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 H3BML4 177 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 DYNC1I1O14576 645 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF264O43296 627 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 FRS3O43559 492 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SNX3O60493 162 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 TPST1O60507 370 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 TPST2O60704 377 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 TNFSF13O75888 250 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 AQP8O94778 261 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SOX30O94993 753 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 RCBTB2O95199 551 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PGM3O95394 542 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CLDN14O95500 239 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ANP32DO95626 131 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 KRT75O95678 551 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 AK1P00568 194 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 BCHEP06276 602 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 GKN3PP0CG01 181 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ARAFP10398 606 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 NR2F1P10589 423 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 UBL4AP11441 157 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PEPDP12955 493 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 GP1BBP13224 206 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PRG2P13727 222 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 GABRA1P14867 456 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF17P17021 662 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PRKCAP17252 672 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 IGFBP2P18065 325 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 GPX2P18283 190 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 AGAP20933 346 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ATP6V1C1P21283 382 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 MSX1P28360 303 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 HTR1EP28566 365 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 LSP1P33241 339 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 TIMP3P35625 211 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CRATP43155 626 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CLK3P49761 638 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 P2RX1P51575 399 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CRYBA2P53672 197 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CASP6P55212 293 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 DLX5P56178 289 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PER3P56645 1201 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SESN3P58005 492 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 MTPNP58546 118 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 STX1BP61266 288 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 KCNJ10P78508 379 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SRYQ05066 204 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 LRRC74AQ0VAA2 488 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 EPS8Q12929 822 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 GANABQ14697 944 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 QPRTQ15274 297 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 GUSBP1Q15486 140 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 BCL2A1Q16548 175 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 HSP90B2PQ58FF3 399 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SLC25A53Q5H9E4 307 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 C6orf10Q5SRN2 563 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 RAET1LQ5VY80 246 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 REP15Q6BDI9 236 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM211Q6ICI0 200 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 VWA1Q6PCB0 445 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 XKRXQ6PP77 449 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF836Q6ZNA1 936 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 C16orf62Q7Z3J2 963 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PIGWQ7Z7B1 504 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 DHDDSQ86SQ9 333 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CALHM3Q86XJ0 350 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 MISPQ8IVT2 679 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 UBQLNLQ8IYU4 475 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms