RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384723.1

RNU6-1104P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1104, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1104P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SMARCB1Q12824 385 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 RAB35Q15286 201 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ACKR1Q16570 336 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 MPPE1Q53F39 396 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 BMP2KLQ5H9B9 411 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ADCK2Q7Z695 626 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ZSCAN30Q86W11 494 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CCDC54Q8NEL0 328 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 C1orf64Q8NEQ6 169 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 OR6M1Q8NGM8 313 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ZFP90Q8TF47 636 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ESR2Q92731 530 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 RIT1Q92963 219 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 TMEM80Q96HE8 168 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 GPR137Q96N19 417 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ZNF559Q9BR84 538 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ATG101Q9BSB4 218 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 TMEM121Q9BTD3 319 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 OR11A1Q9GZK7 315 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SLC26A1Q9H2B4 701 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 VPS28Q9UK41 221 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SEC16AO15027 2179 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CELSR2Q9HCU4 2923 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ZFHX3Q15911 3703 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 FRMPD3Q5JV73 1810 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 KBTBD13C9JR72 458 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 PSMD10O75832 226 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 IGSF6O95976 241 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 P04436 131 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 VIMP08670 466 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CT45A8P0DMV1 189 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CT45A9P0DMV2 189 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SLC26A3P40879 764 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CXCL5P42830 114 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SLC10A7Q0GE19 358 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CDO1Q16878 200 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 TMEM183BQ1AE95 376 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CT45A2Q5DJT8 189 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 TMEM135Q86UB9 458 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 TMEM183AQ8IXX5 376 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ZNF683Q8IZ20 524 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 LRRC52Q8N7C0 313 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SAP25Q8TEE9 199 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ASB9Q96DX5 294 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CXorf58Q96LI9 332 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 APOOQ9BUR5 198 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CAB39LQ9H9S4 337 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SLC2A8Q9NY64 477 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 MIS18AQ9NYP9 233 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ZNF226Q9NYT6 803 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 MAB21L2Q9Y586 359 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 BRWD1Q9NSI6 2320 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 PLXNB1O43157 2135 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 FREM2Q5SZK8 3169 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 LRIT2A6NDA9 550 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 H7C0S8 307 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 XKRYO14609 159 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 TXNDC12O95881 172 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ICAM2P13598 275 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 PAX3P23760 479 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 EPHX2P34913 555 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ACADSBP45954 432 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ASMTP46597 345 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 STARP49675 285 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 LIM2P55344 173 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 TAS2R19P59542 299 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SPIBQ01892 262 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 FOLH1Q04609 750 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CUL4AQ13619 759 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1104P-201ENST00000384723 IHHQ14623 411 aa-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms