RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 TOR3AQ9H497 397 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 HPF1Q9NWY4 346 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 SSUH2Q9Y2M2 353 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 LAMA5O15230 3695 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 NDUFB5O43674 189 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CYP7B1O75881 506 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPACA3Q8IXA5 215 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIF17Q9P2E2 1029 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 NTNG1Q9Y2I2 539 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 ORC6Q9Y5N6 252 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAGEA13PA6NCF6 341 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 H0YAE9 185 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 H3BNH8 94 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADAM10O14672 748 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 OIP5O43482 229 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADAM11O75078 769 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANGPTL1O95841 491 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 GNAO1P09471 354 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBL4AP11441 157 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGFBP5P24593 272 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF136P52737 540 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 HMGA2P52926 109 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 EPS8Q12929 822 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABHD17BQ5VST6 288 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 GIPC3Q8TF64 312 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 DCBLD2Q96PD2 775 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 GALNT9Q9HCQ5 603 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CTPS2Q9NRF8 586 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CARD8Q9Y2G2 431 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 TP53I11O14683 189 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 LYNP07948 512 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 FUT4P22083 530 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 LIMS1P48059 325 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHN2P52757 468 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 SOX8P57073 446 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZSWIM7Q19AV6 140 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 RFX4Q33E94 735 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 KDM4DQ6B0I6 523 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATG16L2Q8NAA4 619 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF138Q8WVD3 245 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 MBOAT4Q96T53 435 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR83Q9NYM4 423 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLRF1Q9NZS2 232 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACAD8Q9UKU7 415 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 C2orf72A6NCS6 295 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 F10P00742 488 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYF6P23409 242 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLK3P49761 638 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCL11P51671 97 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAD23AP54725 363 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 MICAQ29983 383 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 COLEC12Q5KU26 742 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAHD1Q6P587 224 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CBLN3Q6UW01 205 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 LINC00696Q6ZRV3 163 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM71CQ8NEG0 241 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 MCHR1Q99705 422 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 METTL7AQ9H8H3 244 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 LOC400499M0QZD8 3231 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF264O43296 627 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 MITFO75030 526 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CASP3P42574 277 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 KRT80Q6KB66 452 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC81Q6ZN84 652 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 GALNT5Q7Z7M9 940 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR10G2Q8NGC3 310 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 A4GNTQ9UNA3 340 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 AP3D1O14617 1153 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLIC3O95833 236 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTGDSP41222 190 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 HLCSP50747 726 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF117Q03924 483 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 SKP2Q13309 424 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 DUSP19Q8WTR2 217 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 DHRS1Q96LJ7 313 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM118AQ9NWS6 357 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CEP295Q9C0D2 2601 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 GMFGO60234 142 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 H1F0P07305 194 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCL3P10147 92 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10-202ENST00000380221 RYKP34925 604 aa25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms