RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 UQCRC1P31930 480 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 SKP2Q13309 424 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAPK14Q16539 360 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 GTDC1Q4AE62 458 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 COX20Q5RI15 118 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP1ARQ63HQ0 302 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 P4HA3Q7Z4N8 544 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF619Q8N2I2 560 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKFN1Q8N957 763 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR119Q8TDV5 335 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARSGQ96EG1 525 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGRG7Q96K78 797 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACBD3Q9H3P7 528 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM185BQ9H7F4 350 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 CREBBPQ92793 2442 aa17.58■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PNV4 684 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUDT14O95848 222 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKCAP17252 672 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELK4P28324 431 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF1P41567 113 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCR4P51679 360 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 MVDP53602 400 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 STX1BP61266 288 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAC1P63000 192 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 HPCAP84074 193 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGFBP1Q14512 234 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 PON3Q15166 354 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM71CQ8NEG0 241 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFWD2Q8NHY2 731 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO27Q8NI29 283 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 FNDC9Q8TBE3 224 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 OIT3Q8WWZ8 545 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITCHQ96J02 903 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 RMND5AQ9H871 391 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYO9AB2RTY4 2548 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJA2O60884 412 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 H6PDO95479 791 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 NTN1O95631 604 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT75O95678 551 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSTAP01040 98 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 OPN1LWP04000 364 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHRM4P08173 479 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZCCHC18P0CG32 403 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 TLE4Q04727 773 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHRNEQ04844 493 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYPL1Q16563 259 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPAT3Q53EU6 434 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2A2Q6IF42 318 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMGN2P46Q86SG4 172 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 FUNDC1Q8IVP5 155 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5W2Q8NH69 310 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10D3Q8NH80 312 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAT2Q9GZY6 243 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC38A1Q9H2H9 487 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF122Q9H9V4 155 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 STOML1Q9UBI4 398 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNN3Q9UGI6 736 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAMDEC1O15204 470 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFNA2O43921 213 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANP32DO95626 131 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRHP06850 196 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADH6P28332 368 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHC1P29353 583 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGM1P36871 562 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP10-9P60411 292 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLAURQ03405 335 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBFBQ13951 182 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAPK11Q15759 364 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A53Q5H9E4 307 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 C6orf10Q5SRN2 563 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC2A7Q6PXP3 512 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2V1Q8NHB1 315 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 STON2Q8WXE9 905 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 GTF2H4Q92759 462 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZG16BQ96DA0 208 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC46Q96FV0 321 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 LURAP1Q96LR2 239 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL15Q96M94 604 aa17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms