RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 VCANP13611 3396 aa15.2■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 TRIOO75962 3097 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 A6NCN8 305 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 CSF2P04141 144 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 APEX1P27695 318 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 KIAA1024LP59773 190 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 TBRG1Q3YBR2 411 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 FAM3CQ92520 227 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 SLC22A18Q96BI1 424 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 MED18Q9BUE0 208 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 OR52D1Q9H346 318 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ISYNA1Q9NPH2 558 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ATPIF1Q9UII2 106 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 PILRAQ9UKJ1 303 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 H0YGG7 62 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 HPGDSO60760 199 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 NT5EP21589 574 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 CFL1P23528 166 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 HTR1FP30939 366 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 RFX3P48380 749 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 SCN1BQ07699 218 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 DUSP8Q13202 625 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 DSG2Q14126 1118 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 KIR2DS3Q14952 304 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 DCST2Q5T1A1 773 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 PDZK1Q5T2W1 519 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 FHL5Q5TD97 284 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 XKRXQ6PP77 449 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 MARCH9Q86YJ5 346 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 LRRC20Q8TCA0 184 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 CHAC2Q8WUX2 184 aa15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 GABRPO00591 440 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 CT62P0C5K7 136 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 HYAL1Q12794 435 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 FCRLBQ6BAA4 426 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 RAB43Q86YS6 212 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 KLHL36Q8N4N3 616 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 RIPOR3Q96MK2 946 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF350Q9GZX5 532 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 PIGUQ9H490 435 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 HCRTR1O43613 425 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 OR7A10O76100 309 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 IGHA1P01876 353 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 PPP1CAP62136 330 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 SHC2P98077 582 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 OR1Q1Q15612 314 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 YIF1BQ5BJH7 314 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ZAR1Q86SH2 424 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 MRGPRX1Q96LB2 322 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 UQCC2Q9BRT2 126 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 TEX12Q9BXU0 123 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 PTGFRNQ9P2B2 879 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 GXYLT2A0PJZ3 443 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 UNC119BA6NIH7 251 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 TNFSF14O43557 240 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 AGR2O95994 175 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 P2RY14Q15391 338 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ALG11Q2TAA5 492 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 TOR2AQ5JU69 321 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 EOGTQ5NDL2 527 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF619Q8N2I2 560 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 NEIL3Q8TAT5 605 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa15.18■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 TRAPPC13A5PLN9 417 aa15.17■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 PLA2G10O15496 165 aa15.17■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 HRO43593 1189 aa15.17■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 PLAURQ03405 335 aa15.17■□□□□ 0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms