RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 OCLNQ16625 522 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 NDUFA5Q16718 116 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 CLIP4Q8N3C7 705 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 IQCF1Q8N6M8 205 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 IL22RA1Q8N6P7 574 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 KCNE4Q8WWG9 221 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC9A6Q92581 669 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 OR5M11Q96RB7 305 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 CUTCQ9NTM9 273 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 KLHL28Q9NXS3 571 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 MKLN1Q9UL63 735 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 IFT52Q9Y366 437 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 GRK5P34947 590 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 IDUAP35475 653 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 CDK5Q00535 292 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAM2Q15035 370 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 MANEAQ5SRI9 462 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 LCN10Q6JVE6 187 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 NKD1Q969G9 470 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 IGF2RP11717 2491 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 MEN1O00255 615 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 KLK10O43240 276 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 OCM2P0CE71 109 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 SOX18P35713 384 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 IFNGR2P38484 337 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 AVPR1BP47901 424 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 ID2Q02363 134 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 ST3GAL3Q11203 375 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 CLN3Q13286 438 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 MED22Q15528 200 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 USP43Q70EL4 1123 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 VASH2Q86V25 355 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 DTX1Q86Y01 620 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 MR1Q95460 341 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM80Q96HE8 168 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 MGLLQ99685 303 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 OR51E2Q9H255 320 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TPK1Q9H3S4 243 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 PADI1Q9ULC6 663 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 SPACA6W5XKT8 324 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 FITM1A5D6W6 292 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 PRKYO43930 277 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 IFNA8P32881 189 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 PCYT1AP49585 367 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 DUSP5Q16690 384 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF628Q5EBL2 1059 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 RHBDD2Q6NTF9 364 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 ESX1Q8N693 406 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 DIO2Q92813 273 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 ANKHQ9HCJ1 492 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 SRPK3Q9UPE1 567 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 WDR45Q9Y484 360 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 MAU2Q9Y6X3 613 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 AP3D1O14617 1153 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 LDB3O75112 727 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 SULT1C4O75897 302 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 HBQ1P09105 142 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 ACP2P11117 423 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 RORAP35398 523 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms