RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 ZFP41Q8N8Y5 198 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 HTRA1Q92743 480 aa22.14■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 ACSM1Q08AH1 577 aa22.14■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 ASB15Q8WXK1 588 aa22.14■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 PTCHD1Q96NR3 888 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 ENKD1Q9H0I2 346 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 PLCL2Q9UPR0 1127 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 TRAPPC4Q9Y296 219 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 CMAHPQ9Y471 501 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 DNAH14Q0VDD8 3507 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.13■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 DEFA3P59666 94 aa22.13■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 THSD4Q6ZMP0 1018 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 LAX1Q8IWV1 398 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 OR51G2Q8NGK0 314 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 IFT27Q9BW83 186 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 TRIM2Q9C040 744 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 Q9N2J8 555 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 SOHLH2Q9NX45 425 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 EYSQ5T1H1 3165 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 METTL12A8MUP2 240 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 HCN1O60741 890 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 DLGAP3O95886 979 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 CLEC2LP0C7M8 214 aa22.13■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 GABRA4P48169 554 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 SLC9A3P48764 834 aa22.13■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 MED20Q9H944 212 aa22.13■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 CLDN16Q9Y5I7 305 aa22.13■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF749O43361 778 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 ADAM11O75078 769 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 RFPL3O75679 317 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 SDC2P34741 201 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF141Q15928 474 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 ARMC4Q5T2S8 1044 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF426Q9BUY5 554 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 V9GYH0 126 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa22.11■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 GFERP55789 205 aa22.11■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 ALG10BQ5I7T1 473 aa22.11■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 SLC35B4Q969S0 331 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 TGM7Q96PF1 710 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 G6PC3Q9BUM1 346 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 ERVK-19Q9WJR5 959 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 SLC35F4A4IF30 521 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 TLCD2A6NGC4 264 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 PGDP52209 483 aa22.11■■□□□ 1.13
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