RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293880.9

SSRP1-202, Transcript of structure specific recognition protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SSRP1, Length 6,296 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1-202ENST00000293880 C7P10643 843 aa15.18■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 RNH1P13489 461 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 DRD2P14416 443 aa15.18■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 ERVK-16P61578 105 aa15.18■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 CCNJQ5T5M9 372 aa15.18■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 NADSYN1Q6IA69 706 aa15.18■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 SPARTQ8N0X7 666 aa15.18■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 TTC9BQ8N6N2 239 aa15.18■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 ANKRD60Q9BZ19 345 aa15.18■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 RASD1Q9Y272 281 aa15.18■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 SPO11Q9Y5K1 396 aa15.18■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 FADS1O60427 444 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 NKX3-2P78367 333 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 HHEXQ03014 270 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 ERV3-1Q14264 604 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 RAB30Q15771 203 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 PRSS21Q9Y6M0 314 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 VIPR2P41587 438 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 ACSM3Q53FZ2 586 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 STEAP4Q687X5 459 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 APOOLQ6UXV4 268 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 C20orf24Q9BUV8 137 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 CD300LBA8K4G0 201 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 ACTL6BO94805 426 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 CSF1P09603 554 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 AHRP35869 848 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 PPT1P50897 306 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 LPAL2Q16609 132 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 OR4F15Q8NGB8 312 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 LINC01599Q8WXQ3 324 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 IGSF21Q96ID5 467 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 SYT3Q9BQG1 590 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 ZNF416Q9BWM5 594 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 FAM86C1Q9NVL1 165 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 POLHQ9Y253 713 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 CBY1Q9Y3M2 126 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 DNAJB5O75953 348 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 GPR19Q15760 415 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 CMIPQ8IY22 773 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 KDM8Q8N371 416 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 BORCS6Q96GS4 357 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 MVB12BQ9H7P6 319 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 GLTPQ9NZD2 209 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 BOLA1Q9Y3E2 137 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 CDC14CA4D256 554 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 TPT1P13693 172 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 ILKQ13418 452 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 KIAA0319Q5VV43 1072 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 SHDQ96IW2 340 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 XYLT2Q9H1B5 865 aa15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 C17orf105B2RV13 164 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 JRKO75564 520 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 APLNRP35414 380 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 WNT7BP56706 349 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 ERVFC1P60507 584 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 IL13RA1P78552 427 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 SELPLGQ14242 412 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 CST9LP1Q5W188 147 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 ZNF783Q6ZMS7 281 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 MDGA1Q8NFP4 955 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 SPTSSAQ969W0 71 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 TAS2R8Q9NYW2 309 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 FTCDNL1E5RQL4 147 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 MLF1P58340 268 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 UBE2KP61086 200 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 C3orf38Q5JPI3 329 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 FAM111BQ6SJ93 734 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 OR9K2Q8NGE7 335 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 OR52R1Q8NGF1 315 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 TAS2R16Q9NYV7 291 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 RIMS3Q9UJD0 308 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 ACAD8Q9UKU7 415 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 IFT172Q9UG01 1749 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 PRAMEF2O60811 474 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 HSD17B1P14061 328 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 ZBTB8AQ96BR9 441 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 DZANK1Q9NVP4 752 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 FMN2Q9NZ56 1722 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 GPR39O43194 453 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 BMP2P12643 396 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 ZNF33AQ06730 810 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 SLC22A6Q4U2R8 563 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 RAB41Q5JT25 222 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 UBE2NLQ5JXB2 153 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 MOB3CQ70IA8 216 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 LRP10Q7Z4F1 713 aa15.16■□□□□ 0.02
SSRP1-202ENST00000293880 C12orf42Q96LP6 360 aa15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms