RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 HPGDSO60760 199 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SNU13P55769 128 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 GPR139Q6DWJ6 353 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 HORMAD2Q8N7B1 307 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 UBTD2Q8WUN7 234 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 REV1Q9UBZ9 1251 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 A8MVJ9 347 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SGK494L7N484 410 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT1P36639 197 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SYPL1Q16563 259 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF765Q7L2R6 523 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC22Q8N4W6 341 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 OR7G2Q8NG99 324 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 OR14L1PQ8NHC6 308 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 GLYATL2Q8WU03 294 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 DCUN1D4Q92564 292 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 CLSTN3Q9BQT9 956 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A18Q9H1K4 315 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 TIAM2Q8IVF5 1701 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 EFCAB7A8K855 629 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 F8W036 122 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 KNG1P01042 644 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 BLOC1S1P78537 153 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF160Q9HCG1 818 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 MED17Q9NVC6 651 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 NPIPA7E9PJI5 369 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 GPRIN2O60269 458 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SPDEFO95238 335 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 NPIPA8P0DM63 369 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ARSBP15848 533 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 MAOAP21397 527 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 HTR3AP46098 478 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2UQ5VVX9 321 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 OR52R1Q8NGF1 315 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 LCATP04180 440 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 DLSTP36957 453 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 HOXC5Q00444 222 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZSR6 202 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CMTM1Q8IZ96 169 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 MYH13Q9UKX3 1938 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ARSAP15289 507 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM14Q96QK8 99 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 GPR75O95800 540 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ALDOBP05062 364 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CPMP14384 443 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 RAC2P15153 192 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 PSMB10P40306 273 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 FOXK1P85037 733 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 MELKQ14680 651 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SRPK3Q9UPE1 567 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SCN11AQ9UI33 1791 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 BRINP1O60477 761 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 RAB40ALP0C0E4 278 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ECH1Q13011 328 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRRQ15256 657 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 RCBTB1Q8NDN9 531 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 OR5D14Q8NGL3 314 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 RAB40AQ8WXH6 277 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 TPSD1Q9BZJ3 242 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 LDB3O75112 727 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A7Q9Y694 548 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 C1SP09871 688 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 OR1Q1Q15612 314 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 VRK2Q86Y07 508 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 FAM3CQ92520 227 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 TOMM40LQ969M1 308 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ASF1BQ9NVP2 202 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 EDARQ9UNE0 448 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 H3BML4 177 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CEBPBP17676 345 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 PTPN6P29350 595 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 XCR1P46094 333 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 IRF4Q15306 451 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 WBP2NLQ6ICG8 309 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 LILRA2Q8N149 483 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CRB3Q9BUF7 120 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 KLK4Q9Y5K2 254 aa19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms