RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 SUN3Q8TAQ9 357 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM80Q96HE8 168 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MDFIQ99750 246 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NUDT9Q9BW91 350 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PINK1Q9BXM7 581 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NUAK2Q9H093 628 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SPNS1Q9H2V7 528 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SELENONQ9NZV5 590 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SSR3Q9UNL2 185 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 IFT52Q9Y366 437 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 DSPPQ9NZW4 1301 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0A6YYD5 115 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PRQ8 180 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 AGAP5A6NIR3 686 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 DUXAA6NLW8 204 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 M0R082 166 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 HMGN4O00479 90 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MYL12BO14950 172 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ASNA1O43681 348 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 UPK1BO75841 260 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX4O95219 450 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 EML2O95834 649 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PTTG1O95997 202 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 GASTP01350 101 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ALPPP05187 535 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CEACAM5P06731 702 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM157BP0CG42 384 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 HSMCR30P0CW71 290 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ADORA3P0DMS8 318 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 OR12D1P0DN82 309 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MYL12AP19105 171 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CD33P20138 364 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFRSF1BP20333 461 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CHMP24386 653 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 GADD45AP24522 165 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PKLRP30613 574 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 IDUAP35475 653 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM23P36406 574 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 LIPAP38571 399 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 GSSP48637 474 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SEPHS1P49903 392 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SMSP52788 366 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CASP9P55211 416 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 GFERP55789 205 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 NCS1P62166 190 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MED22Q15528 200 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TESK1Q15569 626 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SZRD1Q7Z422 152 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC103Q8IW40 242 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC37A2Q8TED4 501 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PRRC1Q96M27 445 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6C1Q96RD1 312 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MGLLQ99685 303 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 DPH7Q9BTV6 452 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC32Q9BV29 185 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SARGQ9BW04 601 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms