RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262435.13

SMURF2-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2-201ENST00000262435 FN3KQ9H479 309 aa14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 CHST10O43529 356 aa14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 CTSVO60911 334 aa14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 EFCAB14O75071 495 aa14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 ALX3O95076 343 aa14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 PPP1R3DO95685 299 aa14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 DRD5P21918 477 aa14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 GRPRP30550 384 aa14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 CRMP1Q14194 572 aa14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 PDGFRLQ15198 375 aa14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 DECR1Q16698 335 aa14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 NRROSQ86YC3 692 aa14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 PEX11GQ96HA9 241 aa14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 SDF2Q99470 211 aa14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.63□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 FAM171A2A8MVW0 826 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 ARHGEF9O43307 516 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 TOXO94900 526 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 NT5EP21589 574 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 TALDO1P37837 337 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 CLDN20P56880 219 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 OR1Q1Q15612 314 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 NIPAL3Q6P499 406 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 LYPD4Q6UWN0 246 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 MRGPREQ86SM8 312 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 HMGB4Q8WW32 186 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 GPR174Q9BXC1 333 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 NT5DC2Q9H857 520 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 GXYLT2A0PJZ3 443 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 CENPBD1B2RD01 187 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 LAMP2P13473 410 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 CXCL3P19876 107 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 CMPK1P30085 196 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 TTLQ8NG68 377 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 OR7G1Q8NGA0 311 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 OR52L1Q8NGH7 329 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 TMEM239Q8WW34 195 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 SMARCD2Q92925 531 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 IL21RQ9HBE5 538 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 CLDND1Q9NY35 253 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 IRGMA1A4Y4 181 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 CDHR4A6H8M9 788 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 SEC14L5O43304 696 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 IGHA1P01876 353 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 HLA-DMAP28067 261 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 SSTR2P30874 369 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 UQCRC1P31930 480 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 GNG2P59768 71 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 SFXN5Q8TD22 340 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 TEAD3Q99594 435 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 MARVELD1Q9BSK0 173 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.62□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 A0A087WV48 116 aa14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 SYT5O00445 386 aa14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 GIFP27352 417 aa14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 PRKAR1BP31321 381 aa14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 IGFALSP35858 605 aa14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 FOXK2Q01167 660 aa14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 TFF2Q03403 129 aa14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 NTRK2Q16620 822 aa14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 CEP78Q5JTW2 689 aa14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 HSD17B8Q92506 261 aa14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 GHSRQ92847 366 aa14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 RFT1Q96AA3 541 aa14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 BPIFA2Q96DR5 249 aa14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.61□□□□□ -0.07
SMURF2-201ENST00000262435 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms