RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 HTR2AP28223 471 aa16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 NPRL3Q12980 569 aa16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 RAPSNQ13702 412 aa16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 KEAP1Q14145 624 aa16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 LY6DQ14210 128 aa16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 FGFBP1Q14512 234 aa16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM205Q6UW68 189 aa16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF614Q8N883 585 aa16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF441Q8N8Z8 693 aa16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 PITX2Q99697 317 aa16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 CRB3Q9BUF7 120 aa16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 FLRT3Q9NZU0 649 aa16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 NBEAQ8NFP9 2946 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 DPPA5A6NC42 116 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 ARGFXA6NJG6 315 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 OR5F1O95221 314 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 NTN1O95631 604 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 CLPTM1O96005 669 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 ADAP00813 363 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 CYC1P08574 325 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 POU2F1P14859 743 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 RRADP55042 308 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 DCAF7P61962 342 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 DECR1Q16698 335 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 KCTD21Q4G0X4 260 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 PGBD2Q6P3X8 592 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 KLHL17Q6TDP4 642 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 PCSK4Q6UW60 755 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 THAP5Q7Z6K1 395 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF786Q8N393 782 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 APCDD1LQ8NCL9 501 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 OR4C3Q8NH37 302 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 METTL21AQ8WXB1 218 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 NACC2Q96BF6 587 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 SEMA4CQ9C0C4 833 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 MGAT4BQ9UQ53 548 aa16.03■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 IGSF10Q6WRI0 2623 aa16.02■□□□□ 0.16
SRSF1-201ENST00000258962 TO15178 435 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 OR10H3O60404 316 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 ADAM11O75078 769 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 IGHEP01854 428 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 UMODP07911 640 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 MMP11P24347 488 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 RPL5P46777 297 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 ISL1P61371 349 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 ST3GAL3Q11203 375 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 ATP1A4Q13733 1029 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 TRAM2Q15035 370 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 SLC29A4Q7RTT9 530 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 GDF7Q7Z4P5 450 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 MRGPREQ86SM8 312 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 PARP8Q8N3A8 854 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 EXD3Q8N9H8 876 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 B3GNT7Q8NFL0 401 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 OR4K5Q8NGD3 323 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 ARSGQ96EG1 525 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 SLC41A3Q96GZ6 507 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 ANKRD19PQ9H560 264 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 ARMC7Q9H6L4 198 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF556Q9HAH1 456 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 ENOPH1Q9UHY7 261 aa16.02■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 A0A087WUU8 490 aa16.01■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 MKRN2OSH3BPM6 223 aa16.01■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 FMO6PO60774 539 aa16.01■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 LYPD3O95274 346 aa16.01■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 ELK4P28324 431 aa16.01■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 RYKP34925 604 aa16.01■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 TUBA4AP68366 448 aa16.01■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 RPP38P78345 283 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 CD47Q08722 323 aa16.01■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 APOFQ13790 326 aa16.01■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 KLHL26Q53HC5 615 aa16.01■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa16.01■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 LAIR2Q6ISS4 152 aa16.01■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 NKAIN4Q8IVV8 208 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms