RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ankrd37Q569N2 159 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lpcat4Q6NVG1 524 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Eif2s1Q6ZWX6 315 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tas2r110Q7M712 333 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tas2r117Q7M715 330 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr835Q7TRG7 311 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Muc20Q8BUE7 656 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Irf2bplQ8K3X4 775 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cela1Q91X79 266 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 BollQ924M5 281 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spred1Q924S8 444 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmed10Q9D1D4 219 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cers5Q9D6K9 414 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Marveld3Q9D956 376 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dennd6bQ9D9V7 585 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fkbp9Q9Z247 570 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Otud4B2RRE7 1107 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr544E9PX47 334 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r106E9PY92 862 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr376E9Q4M1 320 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dbil5O09035 87 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 IapP24822 559 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hsd3b2P26149 373 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tead1P30051 426 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pitx2P97474 317 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prelid2Q0VBB0 177 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hif3aQ0VBL6 662 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmub2Q3V209 319 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc26a10Q5EBI0 492 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Muc19Q6JHY2 733 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1134Q7TR43 312 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Thnsl2Q80W22 483 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc25a21Q8BZ09 298 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r219Q8R271 312 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r83Q8R287 306 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1312Q8VF10 317 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyc1Q9D0M3 325 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q9D4W2 315 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fgf20Q9ESL9 211 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nrip3Q9JJR9 240 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PtgfrnQ9WV91 879 aa9.52□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp873A0A1B0GT64 667 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 A0A1W2P799 418 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tox2A2A472 547 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1095A3KPP7 308 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 5430401F13RikE9Q328 175 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adam3F8VQ03 822 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Efna3O08545 230 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pdlim3O70209 316 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Papss2O88428 621 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cd14P10810 366 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Klri2Q5DT36 248 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc22a13Q6A4L0 551 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cldn34b3Q80ZS5 209 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ubash3bQ8BGG7 638 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrrc39Q8BGI7 337 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MepceQ8K3A9 666 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mcfd2Q8K5B2 145 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RergQ8R367 199 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1232Q8VEX7 311 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Satb2Q8VI24 733 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Clec2dQ91V08 207 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 LsrQ99KG5 594 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Exo5Q9CXP9 373 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem269Q9D4Y8 254 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spesp1Q9D5A0 399 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spo11Q9WTK8 396 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdh20Q9Z0M3 801 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 HaspinQ9Z0R0 754 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RfxankQ9Z205 269 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kif26bQ7TNC6 2112 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Piezo2Q8CD54 2822 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sult2a6B2RVI8 285 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpr137cE9Q343 423 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2610001J05RikF2Z3Y9 59 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zbtb25G3UW50 439 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fbxw15L7N1X6 466 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hoxc11P31313 304 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RetP35546 1115 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 HccsP53702 272 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Barhl1P63157 327 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mfsd12Q3U481 476 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spag8Q3V0Q6 470 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc29a2Q61672 456 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Heatr6Q6P1G0 1184 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcp4l1Q6W8Q3 68 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tha1Q6XPS7 400 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CtsoQ8BM88 312 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Unc119bQ8C4B4 251 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nmral1Q8K2T1 309 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dapk2Q8VDF3 370 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1461Q8VEV7 312 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr781Q8VFZ8 311 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q99LU8 229 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rps19Q9CZX8 145 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpn3Q9D3W4 284 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q9DAY5 185 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fbxw5Q9QXW2 573 aa9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acox1Q9R0H0 661 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igkv9-123A0A140T8N8 117 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.6 ms