RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	KIR3DL1	P43629	444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	HK3	P52790	923 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CD163	Q86VB7	1156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	KY	Q8NBH2	561 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MYADM	Q96S97	322 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RAB26	Q9ULW5	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ANHX	E9PGG2	379 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TOR1A	O14656	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CLPX	O76031	633 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CEACAM1	P13688	526 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CKMT2	P17540	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68	3e-7	■■■■□ 25
TCF4-280	ENST00000636751	TPMT	P51580	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	HHEX	Q03014	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SFXN5	Q8TD22	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	DHRS7	Q9Y394	339 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TBX1	O43435	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	APCDD1	Q8J025	514 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	HDAC3	O15379	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RFPL3	O75679	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CDK1	P06493	297 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PCGF2	P35227	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CCR10	P46092	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RHD	Q02161	417 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TRBC2	A0A5B9	178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	LRP5L	A4QPB2	252 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	DSCR3	O14972	297 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	LEFTY1	O75610	366 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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