RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	VPS11	Q9H270	941 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	B3GALT2	O43825	422 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	IGHV3-9	P01782	118 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	PCSK2	P16519	638 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	SHC1	P29353	583 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	NOS3	P29474	1203 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	CDC25B	P30305	580 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	CALCR	P30988	508 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	HSD17B2	P37059	387 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	MAGEB1	P43366	347 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	ZBTB17	Q13105	803 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	RCN2	Q14257	317 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	SPIC	Q8N5J4	248 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	GPATCH11	Q8N954	259 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	NT5C	Q8TCD5	201 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	TSGA13	Q96PP4	275 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF649	Q9BS31	505 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	CEP41	Q9BYV8	373 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	CLIC4	Q9Y696	253 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	PCDH7	O60245	1069 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	FBP1	P09467	338 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	NAT2	P11245	290 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	NAGA	P17050	411 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	SAT1	P21673	171 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	EPHA3	P29320	983 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	STT3A	P46977	705 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	BTN3A2	P78410	334 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	CCL8	P80075	99 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	HGFAC	Q04756	655 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	ITIH4	Q14624	930 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	FCRLA	Q7L513	359 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	CCNY	Q8ND76	341 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	FBXO27	Q8NI29	283 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	DOK4	Q8TEW6	326 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	OSTF1	Q92882	214 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	NEURL3	Q96EH8	262 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	OR5M11	Q96RB7	305 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	NABP2	Q9BQ15	211 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	DSN1	Q9H410	356 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	RAB18	Q9NP72	206 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	CACNG2	Q9Y698	323 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-222	ENST00000626061	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A0U1RQV1	116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	CCDC189	A1A4V9	331 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	AQP7P3	A6NL99	342 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	P2RY10	O00398	339 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	CCL22	O00626	93 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	ADAMDEC1	O15204	470 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	OR1F1	O43749	312 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	UGT2B11	O75310	529 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	IGHV1-69	P01742	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	OPN1LW	P04000	364 aa		5.08	□□□□□ -1.6

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