RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 CCNJQ5T5M9 372 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRF-216ENST00000617451 LIPMQ5VYY2 423 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRF-216ENST00000617451 ADAM5Q6NVV9 412 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRF-216ENST00000617451 GABRG1Q8N1C3 465 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRF-216ENST00000617451 CEP112Q8N8E3 955 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRF-216ENST00000617451 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRF-216ENST00000617451 RNF128Q8TEB7 428 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRF-216ENST00000617451 S100PBPQ96BU1 408 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRF-216ENST00000617451 BTBD2Q9BX70 525 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRF-216ENST00000617451 SOX30O94993 753 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 SFTPDP35247 375 aa22.2■■□□□ 1.14
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PTPRF-216ENST00000617451 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 TNK1Q13470 666 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC63Q8NA47 563 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 ABHD3Q8WU67 409 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 MTERF3Q96E29 417 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 TIGARQ9NQ88 270 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 ADAM21Q9UKJ8 722 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 LAMP3Q9UQV4 416 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 TMED5Q9Y3A6 229 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 LSM1O15116 133 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 EFNA2O43921 213 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 LINC00032P0C843 101 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 ELK4P28324 431 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF117Q03924 483 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 KRTAP1-1Q07627 177 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 FOXF1Q12946 379 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 MLC1Q15049 377 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM201Q5SNT2 666 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 ALKBH2Q6NS38 261 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 TFAP2EQ6VUC0 442 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 JADE3Q92613 823 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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PTPRF-216ENST00000617451 STACQ99469 402 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 SRXN1Q9BYN0 137 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 DUSP22Q9NRW4 184 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL13Q9P2N7 655 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 FIS1Q9Y3D6 152 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 RTTNQ86VV8 2226 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 FREM1Q5H8C1 2179 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 OVOL3O00110 214 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 ADH6P28332 368 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 ASMTP46597 345 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 C10orf107Q8IVU9 208 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 TUSC5Q8IXB3 177 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 PIGUQ9H490 435 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 GP6Q9HCN6 339 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 GIN1Q9NXP7 522 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 RNF115Q9Y4L5 304 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF195O14628 629 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 NTN1O95631 604 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 SHBGP04278 402 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 BCKDHAP12694 445 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 TSC22D1Q15714 1073 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL26Q53HC5 615 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 NCMAPQ5T1S8 102 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 SFRP5Q5T4F7 317 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 KANK2Q63ZY3 851 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 CBLN3Q6UW01 205 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 CDS1Q92903 461 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 TRMOQ9BU70 441 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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PTPRF-216ENST00000617451 ACTL7BQ9Y614 415 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 COPEO14579 308 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 OIP5O43482 229 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 CHEK2O96017 543 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 SOD3P08294 240 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 DANCRP0C864 163 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 IL32P24001 234 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 TAB1Q15750 504 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 CLEC12BQ2HXU8 276 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 GALNTL6Q49A17 601 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 FCRLAQ7L513 359 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 TDRPQ86YL5 185 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO27Q8NI29 283 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 HSD17B8Q92506 261 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 HOXD1Q9GZZ0 328 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 NGBQ9NPG2 151 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 ATP6V1HQ9UI12 483 aa22.16■■□□□ 1.14
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