RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 IL1AP01583 271 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 UBBP0CG47 229 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 THEGLP0DJG4 465 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 PRKACAP17612 351 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 UBA52P62987 128 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 CTSL3PQ5NE16 218 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 NLGN4XQ8N0W4 816 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 OR4N4Q8N0Y3 316 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 GPR26Q8NDV2 337 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 PAQR8Q8TEZ7 354 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 NPRL2Q8WTW4 380 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 SYT11Q9BT88 431 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 NPIPA7E9PJI5 369 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 EGFP01133 1207 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 NPIPA8P0DM63 369 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 DEFB110Q30KQ9 67 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 ENTPD8Q5MY95 495 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 OR1J4Q8NGS1 313 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 PPA2Q9H2U2 334 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 RARRES3Q9UL19 164 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 TP53P04637 393 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 NTSR1P30989 418 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 FGL2Q14314 439 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 DPPA4Q7L190 304 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 ZNF679Q8IYX0 411 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 SGCZQ96LD1 299 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 ANKRD28O15084 1053 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 RAB6AP20340 208 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 SLC14A2Q15849 920 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 SLC6A19Q695T7 634 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 TMEM151BQ8IW70 566 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 TTC9BQ8N6N2 239 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 FNDC9Q8TBE3 224 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 MYLIPQ8WY64 445 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 TM9SF4Q92544 642 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 ZBTB8AQ96BR9 441 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 BPIFA2Q96DR5 249 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 ZNF681Q96N22 645 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 FBRSQ9HAH7 460 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 FTSJ1Q9UET6 329 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 ANTXRLA6NF34 631 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 OR7G1Q8NGA0 311 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 TMEM40Q8WWA1 233 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 NT5DC2Q9H857 520 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 SCN11AQ9UI33 1791 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 J3KTA2 159 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 GMDSO60547 372 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 NCR1O76036 304 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 PGGHGQ32M88 737 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 OR14L1PQ8NHC6 308 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 OR2M2Q96R28 347 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 OR7D2Q96RA2 312 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 LTBP3Q9NS15 1303 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 C17orf105B2RV13 164 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 AGPAT2O15120 278 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 ZNF136P52737 540 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 RAB33AQ14088 237 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 SELPLGQ14242 412 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 MELKQ14680 651 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 PEA15Q15121 130 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 KIAA0895LQ68EN5 471 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 STEAP2Q8NFT2 490 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 HINT2Q9BX68 163 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 EVA1AQ9H8M9 152 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 RLIMQ9NVW2 624 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 ACTR10Q9NZ32 417 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 GABRPO00591 440 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 SRYQ05066 204 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 ZNF337Q9Y3M9 751 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TNS1-220ENST00000611415 MYH10P35580 1976 aa11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms