RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 NINQ8N4C6 2090 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 SERPINB7O75635 380 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 SNX4O95219 450 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF682O95780 498 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 GNLYP22749 145 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 IGFBP5P24593 272 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 PIK3CBP42338 1070 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 TGM3Q08188 693 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 DGCR6Q14129 220 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM16LQ309B1 348 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 QSOX2Q6ZRP7 698 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 APCDD1LQ8NCL9 501 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 PLPP5Q8NEB5 264 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 OR5M3Q8NGP4 307 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF347Q96SE7 839 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 NEURL2Q9BR09 285 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 RIBC2Q9H4K1 309 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf109Q9NX04 203 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 ASB4Q9Y574 426 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 MAST4O15021 2626 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0A6YYD5 115 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 CLDN25C9JDP6 229 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 DIRAS1O95057 198 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 LRATO95237 230 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 C1QCP02747 245 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 SELLP14151 372 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 CDKN2CP42773 168 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 MAP2K4P45985 399 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 DUSP2Q05923 314 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 CD300CQ08708 224 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 CDK5R2Q13319 367 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 PLAG1Q6DJT9 500 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 NIPAL1Q6NVV3 410 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM46Q7Z4K8 759 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 GALNT10Q86SR1 603 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP4Z1Q86W10 505 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 GAL3ST4Q96RP7 486 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 RHNO1Q9BSD3 238 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 EPS8L2Q9H6S3 715 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 SERHLQ9NQF3 203 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 MYO1GB0I1T2 1018 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM220BPB1ANY3 271 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 PROM1O43490 865 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 UGT2B11O75310 529 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 TACR1P25103 407 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 MAPK12P53778 367 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 CDONQ4KMG0 1287 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM35AQ53FP2 167 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 MDGA2Q7Z553 956 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 NUDT13Q86X67 352 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 OR7A2PQ8NGA2 310 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 NDNFQ8TB73 568 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 FAR1Q8WVX9 515 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 TAMM41Q96BW9 452 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 REPS1Q96D71 796 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 DEFB126Q9BYW3 111 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 SDHAF3Q9NRP4 125 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 ERVK-18Q9QC07 812 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 SNX6Q9UNH7 406 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 TACC2O95359 2948 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 GABRR3A8MPY1 467 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 DPM1O60762 260 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 SSTR4P31391 388 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 S100A3P33764 101 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 GALNSP34059 522 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 CD96P40200 585 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 LTB4RQ15722 352 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 PGS1Q32NB8 556 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 HIPK1Q86Z02 1210 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 ZFP90Q8TF47 636 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 RORBQ92753 470 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 PYURFQ96I23 114 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 TAAR6Q96RI8 345 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 TRPS1Q9UHF7 1281 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 ABCG2Q9UNQ0 655 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 EML6Q6ZMW3 1958 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 SAGE2PA6NJ88 616 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC16A6O15403 523 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 CTNSO60931 367 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2J2O76002 312 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 NR2F6P10588 404 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 HPCAL1P37235 193 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 TAS2R50P59544 299 aa11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms