RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591856.1

EFTUD2-221, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-221ENST00000591856 PGM1P36871 562 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 RFC3P40938 356 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 MAGEA5P43359 124 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 CPA2P48052 419 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 GSK3BP49841 420 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 CRYBA2P53672 197 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 PSME3P61289 254 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 ART3Q13508 389 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 GPR68Q15743 365 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 TMEM44Q2T9K0 475 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 LIN52Q52LA3 116 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 KRT73Q86Y46 540 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF440Q8IYI8 595 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 OR2T12Q8NG77 320 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 OR4K17Q8NGC6 315 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 WDR60Q8WVS4 1066 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 ZG16BQ96DA0 208 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 NSL1Q96IY1 281 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 ECSITQ9BQ95 431 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 LAT2Q9GZY6 243 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 EVA1AQ9H8M9 152 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-221ENST00000591856 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 MED12LQ86YW9 2145 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 OR14I1A6ND48 311 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 CCT8L1PA6NM43 557 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM166BA8MTA8 275 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 C5orf58C9J3I9 102 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 SYT5O00445 386 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 GNB5O14775 395 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF264O43296 627 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 OIP5O43482 229 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 HCRTR2O43614 444 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 GDF1P27539 372 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 ELK4P28324 431 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 P2RX1P51575 399 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 MLLT10P55197 1068 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 GFRA1P56159 465 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 PPIAP62937 165 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 KCNJ10P78508 379 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 FOXK1P85037 733 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 PLGLB1Q02325 96 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 TLE1Q04724 770 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 LIPEQ05469 1076 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 EIPR1Q53HC9 387 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 COLEC12Q5KU26 742 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 CBLN3Q6UW01 205 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 C16orf89Q6UX73 402 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 TRILQ7L0X0 811 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 MICU2Q8IYU8 434 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 GHDCQ8N2G8 530 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 OR52P1PQ8NH57 321 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 OR5W2Q8NH69 310 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 NEIL3Q8TAT5 605 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 ST8SIA1Q92185 356 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 GNRHR2Q96P88 292 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF607Q96SK3 696 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 ALG2Q9H553 416 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 PTGES2Q9H7Z7 377 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 CD300AQ9UGN4 299 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-221ENST00000591856 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms