RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	BEX2	Q9BXY8	128 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	EQTN	Q9NQ60	294 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TIMM22	Q9Y584	194 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	DYSF	O75923	2080 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	DLX3	O60479	287 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	PRKD3	O94806	890 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	YES1	P07947	543 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	PRPS2	P11908	318 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	IMPDH1	P20839	514 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	PTN	P21246	168 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	LCN1	P31025	176 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	SFTPD	P35247	375 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	NUDT6	P53370	316 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	PKNOX1	P55347	436 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	TEX35	Q5T0J7	233 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	AGAP6	Q5VW22	663 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	FCRLA	Q7L513	359 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ZAR1	Q86SH2	424 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	RELL1	Q8IUW5	271 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	MISP	Q8IVT2	679 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM237	Q96Q45	408 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	KCNA7	Q96RP8	456 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	PAFAH2	Q99487	392 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	NTM	Q9P121	344 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169		A0A1W2PQD3	144 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ESYT3	A0FGR9	886 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC151	A5D8V7	595 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	GOLGA8R	I6L899	631 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	KCNK2	O95069	426 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ACP2	P11117	423 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	TAC1	P20366	129 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ELK4	P28324	431 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	OR3A2	P47893	321 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	CASP9	P55211	416 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	CDH11	P55287	796 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	LCP2	Q13094	533 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	PPA1	Q15181	289 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	CD226	Q15762	336 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169		Q6ZT83	130 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	SSX8	Q7RTT4	187 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	SLC43A2	Q8N370	569 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	BCO1	Q9HAY6	547 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	CUBN	O60494	3623 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	GJE1	A6NN92	205 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF195	O14628	629 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ABCD4	O14678	606 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	RGS14	O43566	566 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	LYZL6	O75951	148 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	PGM3	O95394	542 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	HPGD	P15428	266 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	SLC25A16	P16260	332 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ENPP1	P22413	925 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	TTK	P33981	857 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	PRIM2	P49643	509 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	PRKAA2	P54646	552 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	FOXA1	P55317	472 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	SLC7A5	Q01650	507 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	FOXF1	Q12946	379 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	HSPB3	Q12988	150 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	DUSP5	Q16690	384 aa		10.06	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms